More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2339 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2339  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3351  transcriptional regulator NrdR  70.62 
 
 		 162 aa  231  3e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.634201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2946  transcriptional regulator NrdR  67.7 
 
 		 162 aa  224  5.0000000000000005e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2658  ATP-cone domain protein  67.33 
 
 		 176 aa  193  1e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 150 aa  138  3.9999999999999997e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  52.78 
 
 		 156 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1574  ATP-cone domain protein  45.27 
 
 		 154 aa  137  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1431  transcriptional regulator NrdR  46.1 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  47.17 
 
 		 161 aa  137  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  45.27 
 
 		 151 aa  137  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  46.75 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  44.9 
 
 		 148 aa  133  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  40.82 
 
 		 159 aa  132  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  39.87 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 158 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  45.7 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  47.59 
 
 		 154 aa  131  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  45.75 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  46.9 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  46.9 
 
 		 154 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  46.9 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  46.9 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  46.9 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  44.37 
 
 		 174 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  40.14 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  44.81 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  47.33 
 
 		 176 aa  128  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03371  transcriptional regulator NrdR  39.46 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  45.75 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1870  ATP-cone domain protein  44.9 
 
 		 175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0173764  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  45.14 
 
 		 149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  41.22 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  46.21 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 180 aa  127  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  38.51 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  43.95 
 
 		 172 aa  127  7.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  48.28 
 
 		 174 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  44.44 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  43.04 
 
 		 184 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  42.94 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  44.29 
 
 		 155 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  44.83 
 
 		 175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  44.83 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  41.5 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  41.5 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 		 157 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  44.17 
 
 		 185 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0177  ATP-cone domain-containing protein  42.86 
 
 		 152 aa  124  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  46.43 
 
 		 179 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 152 aa  124  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 157 aa  124  7e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 150 aa  124  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  46.43 
 
 		 179 aa  124  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 149 aa  124  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  45.45 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  44.83 
 
 		 155 aa  124  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  42.68 
 
 		 182 aa  123  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 150 aa  123  9e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  44.08 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  43.56 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  43.75 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  41.5 
 
 		 148 aa  123  1e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  123  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  41.67 
 
 		 157 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  45.71 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  46.81 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0669  ATP-cone domain protein  43.75 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.528006  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  44.1 
 
 		 186 aa  122  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  43.05 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  43.05 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  43.05 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  43.05 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  43.05 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  45.71 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 147 aa  121  3e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  45.71 
 
 		 149 aa  121  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>