More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1870 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1870  ATP-cone domain protein  100 
 
 		 175 aa  361  3e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0173764  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  56.67 
 
 		 172 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  52.6 
 
 		 154 aa  180  8.000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  56.38 
 
 		 151 aa  178  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  57.86 
 
 		 149 aa  178  4e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  54.36 
 
 		 172 aa  177  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  53.25 
 
 		 154 aa  176  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 		 154 aa  176  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  57.14 
 
 		 149 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  57.14 
 
 		 149 aa  175  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 149 aa  175  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 149 aa  175  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  57.14 
 
 		 149 aa  175  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 149 aa  175  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 149 aa  175  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  57.14 
 
 		 149 aa  175  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 		 154 aa  174  5e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3286  transcriptional regulator NrdR  55.71 
 
 		 149 aa  174  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 		 154 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 		 154 aa  174  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  46.11 
 
 		 170 aa  174  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  54.67 
 
 		 154 aa  173  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 		 154 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 		 165 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3091  transcriptional regulator NrdR  56.43 
 
 		 149 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 		 154 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1024  transcriptional regulator NrdR  55 
 
 		 149 aa  173  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 		 155 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  55.71 
 
 		 149 aa  173  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 		 154 aa  173  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 		 161 aa  172  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 		 157 aa  171  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3162  transcriptional regulator NrdR  55.71 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  55.71 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  52.17 
 
 		 157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3118  transcriptional regulator NrdR  55.71 
 
 		 149 aa  171  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.125691  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 149 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 149 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 149 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 149 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  53.74 
 
 		 149 aa  171  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  54.29 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 156 aa  168  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1071  transcriptional regulator NrdR  52.86 
 
 		 149 aa  167  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.472866  hitchhiker  0.0011429 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  54.42 
 
 		 149 aa  167  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 		 149 aa  166  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 149 aa  165  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 149 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 149 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 		 174 aa  164  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  52.14 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  164  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  164  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  164  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  164  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 		 149 aa  161  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  52.86 
 
 		 149 aa  161  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  52.03 
 
 		 148 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  50.67 
 
 		 151 aa  161  5.0000000000000005e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1143  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.086063  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1051  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  160  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0419626  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 173 aa  159  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0472  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.687081  hitchhiker  0.000432977 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0296  transcriptional regulator NrdR  52.35 
 
 		 163 aa  158  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0901  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 155 aa  158  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  51.43 
 
 		 154 aa  154  6e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2166  transcriptional regulator NrdR  51.9 
 
 		 158 aa  154  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.13572  normal  0.0195727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4247  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 149 aa  153  1e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.372453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2681  transcriptional regulator NrdR  47.68 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3101  ATP-cone domain protein  46.26 
 
 		 147 aa  151  4e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.202897  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1910  transcriptional regulator NrdR  48.68 
 
 		 181 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.658817  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1849  transcriptional regulator NrdR  48.68 
 
 		 177 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 150 aa  149  3e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  46.25 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2993  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  148  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.701897  normal  0.27543 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0721  transcriptional regulator NrdR  46.21 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109615  normal  0.121751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0677  transcriptional regulator NrdR  46.21 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.726709  normal  0.692453 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2908  transcriptional regulator NrdR  45.52 
 
 		 149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0801227  normal  0.0399759 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2045  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0709551  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2659  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 149 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0802189  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1659  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.114327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  45 
 
 		 162 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  44.52 
 
 		 156 aa  144  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 150 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0763  transcriptional regulator NrdR  47.68 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2875  transcriptional regulator NrdR  44.83 
 
 		 149 aa  142  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.591342  normal  0.528779 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2928  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 147 aa  142  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>