More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2946 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2946  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 162 aa  327  5.0000000000000004e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3351  transcriptional regulator NrdR  87.04 
 
 		 162 aa  287  3e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.634201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2339  transcriptional regulator NrdR  67.7 
 
 		 160 aa  224  5.0000000000000005e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2658  ATP-cone domain protein  70.62 
 
 		 176 aa  214  2.9999999999999998e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  45.7 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 150 aa  140  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  48.97 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  45.27 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 157 aa  137  4.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  47.92 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 149 aa  137  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  46.36 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1431  transcriptional regulator NrdR  44.29 
 
 		 151 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1574  ATP-cone domain protein  43.54 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  46.53 
 
 		 148 aa  134  7.000000000000001e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  46.26 
 
 		 184 aa  134  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  44.37 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  46.58 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  48.28 
 
 		 174 aa  131  3e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  47.22 
 
 		 149 aa  132  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 149 aa  132  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 157 aa  132  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 149 aa  132  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  45.83 
 
 		 150 aa  132  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 158 aa  131  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 149 aa  131  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  46.26 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  44.79 
 
 		 176 aa  130  6e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  47.22 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  48.28 
 
 		 154 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 		 150 aa  130  9e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  47.92 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  47.92 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  47.59 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  47.59 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  47.59 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  47.92 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  47.92 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  47.92 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  47.92 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  47.92 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 154 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  47.92 
 
 		 149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3091  transcriptional regulator NrdR  46.53 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  43.95 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  46.9 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  47.92 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  47.22 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  45.52 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  44.37 
 
 		 174 aa  127  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  46.21 
 
 		 154 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  47.22 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  47.22 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  47.22 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  47.22 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  47.22 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 152 aa  127  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  127  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  45.83 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03371  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  42.67 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 159 aa  127  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  42.28 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  44.68 
 
 		 151 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1143  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 149 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.086063  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  46.9 
 
 		 172 aa  127  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  44.83 
 
 		 154 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  44.83 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  45.52 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  46.21 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3286  transcriptional regulator NrdR  45.83 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 180 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 155 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>