More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1431 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1431  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 151 aa  300  3.0000000000000004e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  50 
 
 		 151 aa  148  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  48.03 
 
 		 153 aa  140  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  40.82 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  43.24 
 
 		 148 aa  139  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  40.67 
 
 		 162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  41.33 
 
 		 154 aa  138  3e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2339  transcriptional regulator NrdR  46.1 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 156 aa  137  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  45.71 
 
 		 151 aa  136  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  136  7.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0669  ATP-cone domain protein  44.08 
 
 		 160 aa  135  1e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.528006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2946  transcriptional regulator NrdR  44.29 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  43.33 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  38.67 
 
 		 156 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  38.67 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0794  transcriptional regulator NrdR  43.33 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.610189  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  43.57 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  45.52 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0177  ATP-cone domain-containing protein  42.67 
 
 		 152 aa  134  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  46.72 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  46.72 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  43.75 
 
 		 174 aa  134  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  40.41 
 
 		 155 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  43.57 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  38 
 
 		 155 aa  133  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  42.36 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  41.61 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  40.82 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  42.36 
 
 		 152 aa  131  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  44.37 
 
 		 176 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0838  ATP-cone domain protein  42.14 
 
 		 163 aa  131  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  41.61 
 
 		 180 aa  130  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  42.67 
 
 		 153 aa  130  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  38.93 
 
 		 159 aa  130  9e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  43.33 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  35.62 
 
 		 157 aa  128  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  37.5 
 
 		 161 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  38.19 
 
 		 160 aa  128  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  40.71 
 
 		 158 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  42.67 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  42.28 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  41.5 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  45 
 
 		 184 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  43.33 
 
 		 179 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  40.28 
 
 		 162 aa  127  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  43.33 
 
 		 179 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  38.19 
 
 		 160 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  44.29 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  41.61 
 
 		 158 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 153 aa  127  8.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  38.19 
 
 		 160 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  42 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  42 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  42 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  42 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  42.28 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  42 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  42 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  42 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  41.43 
 
 		 163 aa  126  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  42 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  42 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  42.07 
 
 		 147 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  38.19 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  39.74 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  40.94 
 
 		 149 aa  124  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  38.41 
 
 		 172 aa  124  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  38.19 
 
 		 176 aa  124  3e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3508  transcriptional regulator NrdR  38.1 
 
 		 181 aa  124  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.130219 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  39.58 
 
 		 186 aa  125  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  37.5 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  36.67 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  41.22 
 
 		 165 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  42 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  43.33 
 
 		 150 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  41.72 
 
 		 151 aa  124  5e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  42 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  36.05 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 158 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3351  transcriptional regulator NrdR  41.43 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.634201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  39.46 
 
 		 159 aa  123  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  38.67 
 
 		 151 aa  123  7e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  123  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  42.57 
 
 		 149 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0789  transcriptional regulator NrdR  40.28 
 
 		 154 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.861935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1584  transcriptional regulator NrdR  39.33 
 
 		 150 aa  123  8.000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  38.78 
 
 		 159 aa  123  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>