More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3351 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3351  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 162 aa  324  3e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.634201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2946  transcriptional regulator NrdR  87.04 
 
 		 162 aa  287  3e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2339  transcriptional regulator NrdR  70.62 
 
 		 160 aa  231  3e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2658  ATP-cone domain protein  75.33 
 
 		 176 aa  213  7e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  47.02 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 156 aa  140  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  45.03 
 
 		 154 aa  138  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 151 aa  137  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  47.62 
 
 		 184 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  44.59 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 159 aa  135  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  48.94 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  45.83 
 
 		 148 aa  135  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03371  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  49.31 
 
 		 156 aa  133  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  44.44 
 
 		 162 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  48.28 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  48.97 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  44.22 
 
 		 148 aa  131  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  47.33 
 
 		 176 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  48.57 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  48.23 
 
 		 151 aa  132  3e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  47.59 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  47.59 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  46.53 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  47.59 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  47.59 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 154 aa  131  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1574  ATP-cone domain protein  41.5 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  43.05 
 
 		 154 aa  130  6e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  130  6.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 156 aa  130  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  43.54 
 
 		 175 aa  130  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  48.61 
 
 		 155 aa  130  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 155 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  39.87 
 
 		 153 aa  130  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 180 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  50 
 
 		 172 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  46.21 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  45.83 
 
 		 149 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 150 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 159 aa  128  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  44.74 
 
 		 179 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 149 aa  128  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  47.59 
 
 		 161 aa  128  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  44.83 
 
 		 175 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  44.74 
 
 		 179 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  44.83 
 
 		 154 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 152 aa  128  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  46.21 
 
 		 154 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 150 aa  128  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 157 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  47.52 
 
 		 156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  42.67 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  45.21 
 
 		 157 aa  127  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  46.94 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  47.14 
 
 		 149 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 151 aa  127  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 153 aa  127  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0838  ATP-cone domain protein  44.16 
 
 		 163 aa  127  9.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  46.9 
 
 		 172 aa  127  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 153 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1143  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.086063  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 147 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  45.75 
 
 		 158 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  45.52 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  45.83 
 
 		 151 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  44.22 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>