More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0177 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0177  ATP-cone domain-containing protein  100 
 
 		 152 aa  306  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  53.64 
 
 		 162 aa  161  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  50.99 
 
 		 156 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  50.99 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  50.33 
 
 		 155 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 		 151 aa  155  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 153 aa  154  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 151 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 150 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 150 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  49.34 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0838  ATP-cone domain protein  46.94 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 		 150 aa  148  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 147 aa  149  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  47.37 
 
 		 153 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 157 aa  147  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  50.34 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  47.65 
 
 		 176 aa  147  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  47.33 
 
 		 154 aa  147  7e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  45.7 
 
 		 154 aa  146  9e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  49.33 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  48.67 
 
 		 150 aa  142  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  45.39 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  47.37 
 
 		 154 aa  142  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  46.67 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  47.33 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 160 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1330  transcriptional regulator NrdR  44.37 
 
 		 151 aa  140  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 157 aa  140  9e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  48.3 
 
 		 170 aa  139  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  44.74 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  44.74 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 152 aa  139  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 163 aa  139  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  45.39 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 149 aa  138  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 156 aa  138  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  46.53 
 
 		 157 aa  138  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  44.37 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  46.26 
 
 		 183 aa  137  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 160 aa  137  6e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0323  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 175 aa  137  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000111081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0344  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 175 aa  137  7e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0225239  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  45.7 
 
 		 174 aa  137  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2080  transcriptional regulator NrdR  47.74 
 
 		 151 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000471331  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2909  ATP-cone domain-containing protein  47.65 
 
 		 162 aa  136  8.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000766609  hitchhiker  0.00220576 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  44.08 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1584  transcriptional regulator NrdR  45.7 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  44.37 
 
 		 182 aa  135  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  43.05 
 
 		 160 aa  135  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  135  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  42.76 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  46 
 
 		 185 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_285  transcriptional regulator  44.22 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000377399  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1431  transcriptional regulator NrdR  42.67 
 
 		 151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  45.58 
 
 		 176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  45.58 
 
 		 170 aa  134  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2122  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 151 aa  134  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  46.94 
 
 		 156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 154 aa  133  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  46.26 
 
 		 151 aa  133  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>