More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3899 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  100 
 
 		 183 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  77.63 
 
 		 154 aa  236  1e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2443  transcriptional regulator NrdR  78.77 
 
 		 154 aa  235  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624059  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  77.24 
 
 		 151 aa  234  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  77.93 
 
 		 161 aa  232  2.0000000000000002e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  74.48 
 
 		 154 aa  230  9e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  76.35 
 
 		 154 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  76.35 
 
 		 154 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  76.35 
 
 		 154 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  73.79 
 
 		 154 aa  229  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  75.34 
 
 		 154 aa  228  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2431  ATP-cone domain protein  67.88 
 
 		 170 aa  226  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  73.2 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  72.79 
 
 		 170 aa  225  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  73.79 
 
 		 156 aa  224  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  72.6 
 
 		 157 aa  223  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  71.33 
 
 		 153 aa  221  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1586  transcriptional regulator NrdR  71.72 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393261  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  69.59 
 
 		 161 aa  218  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1234  transcriptional regulator NrdR  67.72 
 
 		 186 aa  218  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260775  hitchhiker  0.00672311 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  67.92 
 
 		 167 aa  218  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  69.28 
 
 		 178 aa  217  7e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23020  transcriptional regulator NrdR  70.27 
 
 		 163 aa  216  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.19394 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  72.6 
 
 		 170 aa  216  2e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7130  ATP-cone domain protein  70.55 
 
 		 153 aa  215  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  71.92 
 
 		 151 aa  214  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3508  transcriptional regulator NrdR  67.27 
 
 		 181 aa  214  5.9999999999999996e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.130219 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1056  ATP-cone domain protein  66.89 
 
 		 153 aa  213  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3327  ATP-cone domain protein  69.66 
 
 		 167 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3812  ATP-cone domain-containing protein  67.31 
 
 		 172 aa  211  7e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581101  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  64.78 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2426  ATP-cone domain-containing protein  69.44 
 
 		 154 aa  208  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.747365 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  67.12 
 
 		 160 aa  208  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  67.12 
 
 		 164 aa  205  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1508  ATP-cone domain protein  60.9 
 
 		 163 aa  201  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00704462  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17180  transcriptional regulator NrdR  61.73 
 
 		 166 aa  198  3e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.966193 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  60 
 
 		 151 aa  184  5e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  46.55 
 
 		 174 aa  154  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  51.02 
 
 		 163 aa  151  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  52.26 
 
 		 165 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0063  ATP-cone domain-containing protein  52.38 
 
 		 173 aa  147  8e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 150 aa  145  3e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 152 aa  144  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 173 aa  144  5e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  46.41 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 162 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  45.7 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 150 aa  142  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 148 aa  141  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 153 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  141  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 150 aa  141  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  141  6e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  141  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 158 aa  140  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 147 aa  140  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0669  ATP-cone domain protein  48.41 
 
 		 160 aa  140  8e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.528006  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  140  9e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  46 
 
 		 150 aa  140  9e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  46.94 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  46.94 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  46.94 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  44.74 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  39.47 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 155 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 165 aa  139  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 155 aa  138  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 150 aa  138  3.9999999999999997e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 		 157 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 156 aa  138  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0177  ATP-cone domain-containing protein  46.26 
 
 		 152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  39.46 
 
 		 151 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  137  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  137  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  137  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>