More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1234 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1234  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 186 aa  359  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260775  hitchhiker  0.00672311 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3508  transcriptional regulator NrdR  80.81 
 
 		 181 aa  264  5.999999999999999e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.130219 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  75.17 
 
 		 161 aa  234  7e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2431  ATP-cone domain protein  72.15 
 
 		 170 aa  231  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  70.37 
 
 		 163 aa  228  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23020  transcriptional regulator NrdR  75.51 
 
 		 163 aa  226  1e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.19394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1056  ATP-cone domain protein  73.79 
 
 		 153 aa  223  9e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  72.08 
 
 		 154 aa  223  1e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  73.65 
 
 		 167 aa  222  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1586  transcriptional regulator NrdR  72.97 
 
 		 165 aa  221  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393261  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  67.68 
 
 		 164 aa  219  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  67.72 
 
 		 183 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  71.43 
 
 		 154 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  68.52 
 
 		 160 aa  218  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7130  ATP-cone domain protein  70.75 
 
 		 153 aa  217  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  73.15 
 
 		 170 aa  216  1e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  70.67 
 
 		 178 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  73.47 
 
 		 151 aa  215  2.9999999999999998e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  72.11 
 
 		 153 aa  214  7e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2426  ATP-cone domain-containing protein  70.83 
 
 		 154 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.747365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  69.28 
 
 		 156 aa  212  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  72.3 
 
 		 154 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1508  ATP-cone domain protein  67.95 
 
 		 163 aa  212  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00704462  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  72.3 
 
 		 154 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  72.3 
 
 		 154 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2443  transcriptional regulator NrdR  72.79 
 
 		 154 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624059  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  71.43 
 
 		 154 aa  210  7.999999999999999e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  72.11 
 
 		 154 aa  207  9e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3327  ATP-cone domain protein  68.03 
 
 		 167 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  67.81 
 
 		 157 aa  203  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  69.66 
 
 		 151 aa  203  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  69.66 
 
 		 161 aa  202  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3812  ATP-cone domain-containing protein  60.34 
 
 		 172 aa  200  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581101  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  62.75 
 
 		 170 aa  198  3.9999999999999996e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17180  transcriptional regulator NrdR  60.61 
 
 		 166 aa  197  7e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.966193 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  64.9 
 
 		 156 aa  196  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  58.62 
 
 		 151 aa  182  3e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  49.67 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 150 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 150 aa  138  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  48.08 
 
 		 156 aa  137  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 155 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 		 153 aa  137  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 165 aa  136  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 155 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1051  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0419626  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 159 aa  135  5e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 164 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  41.72 
 
 		 156 aa  134  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  41.72 
 
 		 156 aa  134  8e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  39.07 
 
 		 151 aa  134  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1623  transcriptional regulator NrdR  43.95 
 
 		 159 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00056172  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  40 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  40.54 
 
 		 150 aa  133  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0169  putative transcriptional regulator  67 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0650097  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 152 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  40.67 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 150 aa  132  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  132  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  132  3e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 159 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 159 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 159 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 159 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 159 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 159 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 159 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 153 aa  131  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 154 aa  131  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  131  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  45.39 
 
 		 160 aa  131  6e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 153 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1870  ATP-cone domain protein  40 
 
 		 175 aa  130  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0173764  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  48.41 
 
 		 165 aa  130  7.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 173 aa  130  7.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  37.75 
 
 		 153 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  44.94 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  39.74 
 
 		 151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 158 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 151 aa  130  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2242  transcriptional regulator NrdR  43.4 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.279557  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  42.38 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>