More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2159 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 154 aa  309  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 154 aa  309  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 154 aa  309  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  94.04 
 
 		 154 aa  288  2e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2443  transcriptional regulator NrdR  94 
 
 		 154 aa  286  6e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624059  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  90.73 
 
 		 154 aa  283  5e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  80.52 
 
 		 154 aa  250  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  78.57 
 
 		 154 aa  249  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  80.69 
 
 		 161 aa  237  2.9999999999999997e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  77.4 
 
 		 170 aa  235  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  78.08 
 
 		 151 aa  232  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  75.34 
 
 		 157 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  75.82 
 
 		 170 aa  232  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7130  ATP-cone domain protein  73.33 
 
 		 153 aa  231  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  74.5 
 
 		 156 aa  230  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  77.4 
 
 		 183 aa  229  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  78.62 
 
 		 156 aa  229  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  76.55 
 
 		 178 aa  228  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2431  ATP-cone domain protein  72.48 
 
 		 170 aa  225  1e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2426  ATP-cone domain-containing protein  73.61 
 
 		 154 aa  224  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.747365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3327  ATP-cone domain protein  73.79 
 
 		 167 aa  223  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  69.03 
 
 		 161 aa  222  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23020  transcriptional regulator NrdR  70.47 
 
 		 163 aa  219  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.19394 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1056  ATP-cone domain protein  68.63 
 
 		 153 aa  218  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  71.14 
 
 		 151 aa  218  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1586  transcriptional regulator NrdR  69.33 
 
 		 165 aa  219  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393261  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  70.55 
 
 		 163 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  71.03 
 
 		 167 aa  216  6e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  69.74 
 
 		 153 aa  216  8.999999999999998e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3508  transcriptional regulator NrdR  71.34 
 
 		 181 aa  214  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.130219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1234  transcriptional regulator NrdR  72.3 
 
 		 186 aa  212  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260775  hitchhiker  0.00672311 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  70.55 
 
 		 164 aa  208  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  68.49 
 
 		 160 aa  208  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3812  ATP-cone domain-containing protein  66.22 
 
 		 172 aa  204  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1508  ATP-cone domain protein  65.54 
 
 		 163 aa  202  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00704462  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17180  transcriptional regulator NrdR  64.94 
 
 		 166 aa  201  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.966193 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  57.24 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  48.41 
 
 		 174 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 173 aa  144  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  51.02 
 
 		 163 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 152 aa  144  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  50.96 
 
 		 165 aa  141  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 152 aa  141  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  43.14 
 
 		 153 aa  136  7.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0063  ATP-cone domain-containing protein  49.66 
 
 		 173 aa  136  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.987989 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  47.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  47.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  47.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  45.86 
 
 		 162 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  43.42 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 151 aa  133  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0177  ATP-cone domain-containing protein  45.58 
 
 		 152 aa  133  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  40.54 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  46.94 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  39.46 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 174 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  42.18 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 151 aa  131  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 150 aa  131  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 165 aa  131  3.9999999999999996e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>