More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3812 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3812  ATP-cone domain-containing protein  100 
 
 		 172 aa  345  3e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581101  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  72.97 
 
 		 151 aa  222  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7130  ATP-cone domain protein  70.27 
 
 		 153 aa  218  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23020  transcriptional regulator NrdR  64.56 
 
 		 163 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.19394 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  68.67 
 
 		 153 aa  214  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1586  transcriptional regulator NrdR  68.03 
 
 		 165 aa  214  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2431  ATP-cone domain protein  68.92 
 
 		 170 aa  213  9e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  64.2 
 
 		 167 aa  213  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  68.49 
 
 		 157 aa  212  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  67.57 
 
 		 163 aa  212  1.9999999999999998e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  68.03 
 
 		 161 aa  211  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3327  ATP-cone domain protein  67.33 
 
 		 167 aa  210  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  63.31 
 
 		 170 aa  210  5.999999999999999e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  67.31 
 
 		 183 aa  210  7e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  62.5 
 
 		 160 aa  209  2e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2443  transcriptional regulator NrdR  66.89 
 
 		 154 aa  209  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624059  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2426  ATP-cone domain-containing protein  67.36 
 
 		 154 aa  208  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.747365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1508  ATP-cone domain protein  64.74 
 
 		 163 aa  208  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00704462  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  64.86 
 
 		 154 aa  205  3e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  66.22 
 
 		 154 aa  204  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  66.22 
 
 		 154 aa  204  3e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  66.22 
 
 		 154 aa  204  3e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  65.61 
 
 		 164 aa  204  4e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  68.28 
 
 		 154 aa  204  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  65.13 
 
 		 154 aa  204  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  68.28 
 
 		 154 aa  203  8e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3508  transcriptional regulator NrdR  61.63 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.130219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  66.21 
 
 		 156 aa  202  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  64.83 
 
 		 161 aa  201  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  63.7 
 
 		 170 aa  201  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1056  ATP-cone domain protein  63.45 
 
 		 153 aa  200  9e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1234  transcriptional regulator NrdR  60.34 
 
 		 186 aa  200  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260775  hitchhiker  0.00672311 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  65.54 
 
 		 156 aa  199  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  63.01 
 
 		 151 aa  198  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17180  transcriptional regulator NrdR  63.95 
 
 		 166 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.966193 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  60.54 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  60 
 
 		 151 aa  184  5e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  46.41 
 
 		 173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  140  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  140  9e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  51.02 
 
 		 165 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  43.79 
 
 		 156 aa  136  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1910  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 		 181 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.658817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1849  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 		 177 aa  135  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  44.22 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  44.22 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  44.22 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 149 aa  134  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 153 aa  134  9e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 153 aa  133  9e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3162  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3118  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.125691  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  46.41 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  44.22 
 
 		 154 aa  132  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  46.41 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  46.41 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  132  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  46.41 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  46.41 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  132  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>