More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2426 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2426  ATP-cone domain-containing protein  100 
 
 		 154 aa  308  1e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.747365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7130  ATP-cone domain protein  87.92 
 
 		 153 aa  269  1e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3327  ATP-cone domain protein  81.08 
 
 		 167 aa  256  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  80.52 
 
 		 157 aa  253  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  77.7 
 
 		 153 aa  242  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2431  ATP-cone domain protein  76.35 
 
 		 170 aa  240  6e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  75.84 
 
 		 170 aa  237  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23020  transcriptional regulator NrdR  71.52 
 
 		 163 aa  233  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.19394 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  75 
 
 		 154 aa  231  3e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  72.85 
 
 		 151 aa  230  5e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  71.52 
 
 		 163 aa  229  8.000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2443  transcriptional regulator NrdR  73.65 
 
 		 154 aa  229  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624059  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1056  ATP-cone domain protein  70.55 
 
 		 153 aa  228  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  70.47 
 
 		 161 aa  228  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  74.15 
 
 		 167 aa  228  2e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  70.86 
 
 		 160 aa  228  3e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  73.03 
 
 		 161 aa  228  3e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  73.79 
 
 		 154 aa  225  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  73.79 
 
 		 154 aa  225  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  73.79 
 
 		 154 aa  225  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  71.72 
 
 		 154 aa  224  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  71.72 
 
 		 154 aa  224  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1586  transcriptional regulator NrdR  72.79 
 
 		 165 aa  225  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393261  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  71.81 
 
 		 178 aa  224  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  71.62 
 
 		 154 aa  221  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  70.95 
 
 		 156 aa  221  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1234  transcriptional regulator NrdR  69.28 
 
 		 186 aa  216  7e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260775  hitchhiker  0.00672311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  68.97 
 
 		 156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1508  ATP-cone domain protein  66.44 
 
 		 163 aa  214  4e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00704462  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3812  ATP-cone domain-containing protein  67.57 
 
 		 172 aa  213  7e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581101  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  68.97 
 
 		 164 aa  212  9.999999999999999e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  69.66 
 
 		 183 aa  210  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  68.97 
 
 		 151 aa  208  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  66.9 
 
 		 170 aa  206  8e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3508  transcriptional regulator NrdR  66.44 
 
 		 181 aa  206  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.130219 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17180  transcriptional regulator NrdR  61.33 
 
 		 166 aa  194  3e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.966193 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  60.14 
 
 		 151 aa  191  2e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  50.94 
 
 		 165 aa  143  9e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 149 aa  142  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  49.01 
 
 		 156 aa  142  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  140  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 174 aa  139  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0169  putative transcriptional regulator  65.69 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0650097  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  45.03 
 
 		 151 aa  137  7e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  46.67 
 
 		 157 aa  136  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  46.98 
 
 		 149 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  46.98 
 
 		 149 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  49.01 
 
 		 163 aa  136  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  46.98 
 
 		 149 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  44.37 
 
 		 155 aa  135  2e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  49.02 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  42.68 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 150 aa  134  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  42.68 
 
 		 157 aa  134  4e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  41.33 
 
 		 151 aa  134  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  134  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  48.37 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  48.37 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  48.37 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  45.58 
 
 		 151 aa  133  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 174 aa  133  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  48.67 
 
 		 154 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3162  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 160 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0063  ATP-cone domain-containing protein  46.26 
 
 		 173 aa  132  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3118  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.125691  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 150 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>