More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1586 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 167 aa  340  7e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1586  transcriptional regulator NrdR  86.23 
 
 		 165 aa  292  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2431  ATP-cone domain protein  78.95 
 
 		 170 aa  253  9e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23020  transcriptional regulator NrdR  72.39 
 
 		 163 aa  251  4.0000000000000004e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.19394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  76.92 
 
 		 161 aa  251  5.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  74.84 
 
 		 163 aa  246  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  77.12 
 
 		 160 aa  242  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  71.88 
 
 		 164 aa  240  7e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1056  ATP-cone domain protein  72.85 
 
 		 153 aa  238  2.9999999999999997e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  76.87 
 
 		 170 aa  236  8e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1508  ATP-cone domain protein  75.86 
 
 		 163 aa  229  9e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00704462  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7130  ATP-cone domain protein  74.83 
 
 		 153 aa  226  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  72.48 
 
 		 154 aa  226  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  73.47 
 
 		 151 aa  225  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  72.48 
 
 		 154 aa  226  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2426  ATP-cone domain-containing protein  74.31 
 
 		 154 aa  224  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.747365 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  71.33 
 
 		 157 aa  223  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1234  transcriptional regulator NrdR  73.65 
 
 		 186 aa  222  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260775  hitchhiker  0.00672311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3327  ATP-cone domain protein  69.93 
 
 		 167 aa  219  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3508  transcriptional regulator NrdR  69.57 
 
 		 181 aa  219  9.999999999999999e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.130219 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2443  transcriptional regulator NrdR  71.03 
 
 		 154 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624059  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  67.72 
 
 		 153 aa  218  3e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  69.59 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  67.92 
 
 		 183 aa  217  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  71.03 
 
 		 154 aa  216  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  71.03 
 
 		 154 aa  216  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  71.03 
 
 		 154 aa  216  7.999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  71.03 
 
 		 154 aa  214  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  68.97 
 
 		 154 aa  213  7e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  68.21 
 
 		 151 aa  213  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3812  ATP-cone domain-containing protein  64.2 
 
 		 172 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581101  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  62.89 
 
 		 170 aa  212  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  70.34 
 
 		 156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  70.34 
 
 		 161 aa  211  3.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  68.03 
 
 		 178 aa  208  3e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17180  transcriptional regulator NrdR  62.66 
 
 		 166 aa  207  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.966193 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  58 
 
 		 151 aa  188  4e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  48.68 
 
 		 163 aa  147  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  47.3 
 
 		 149 aa  144  5e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3091  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  44.9 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  44.9 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  44.9 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  141  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1024  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  140  7e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 150 aa  140  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3286  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3118  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.125691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3162  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  43.67 
 
 		 158 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1071  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  139  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.472866  hitchhiker  0.0011429 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  42.11 
 
 		 154 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 159 aa  138  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 154 aa  138  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 173 aa  138  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  46.36 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  137  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  47.3 
 
 		 148 aa  137  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  44.97 
 
 		 150 aa  137  8.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  43.33 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  137  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  41.83 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  43.33 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0669  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 		 160 aa  135  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.528006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  44 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 152 aa  134  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  45.71 
 
 		 157 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 174 aa  134  5e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 		 154 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 154 aa  134  7.000000000000001e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>