More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17180 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17180  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 166 aa  338  2.9999999999999998e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.966193 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  69.87 
 
 		 163 aa  223  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  67.9 
 
 		 160 aa  220  7e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1508  ATP-cone domain protein  65.62 
 
 		 163 aa  215  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00704462  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  68.97 
 
 		 164 aa  214  4e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23020  transcriptional regulator NrdR  71.03 
 
 		 163 aa  214  5e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.19394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2431  ATP-cone domain protein  65.79 
 
 		 170 aa  211  3.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  67.59 
 
 		 161 aa  209  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1586  transcriptional regulator NrdR  63.64 
 
 		 165 aa  208  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393261  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1056  ATP-cone domain protein  67.12 
 
 		 153 aa  207  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  62.66 
 
 		 167 aa  207  4e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  68 
 
 		 151 aa  206  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  64.94 
 
 		 154 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  64.94 
 
 		 154 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  64.94 
 
 		 154 aa  201  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  64.43 
 
 		 153 aa  199  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3508  transcriptional regulator NrdR  64.15 
 
 		 181 aa  199  9.999999999999999e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.130219 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  61.21 
 
 		 170 aa  199  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  63.16 
 
 		 154 aa  199  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  64.05 
 
 		 154 aa  198  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  67.12 
 
 		 161 aa  198  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  61.73 
 
 		 183 aa  198  3e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3327  ATP-cone domain protein  64.63 
 
 		 167 aa  198  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2443  transcriptional regulator NrdR  64.94 
 
 		 154 aa  198  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624059  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1234  transcriptional regulator NrdR  60.61 
 
 		 186 aa  197  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260775  hitchhiker  0.00672311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  66.9 
 
 		 170 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7130  ATP-cone domain protein  64.63 
 
 		 153 aa  196  9e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3812  ATP-cone domain-containing protein  63.95 
 
 		 172 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581101  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  64.83 
 
 		 154 aa  194  6e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  61.78 
 
 		 156 aa  194  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  64.14 
 
 		 151 aa  193  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2426  ATP-cone domain-containing protein  62.5 
 
 		 154 aa  190  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.747365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  64.14 
 
 		 154 aa  189  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  61.22 
 
 		 156 aa  186  1e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  61.49 
 
 		 157 aa  186  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  59.06 
 
 		 178 aa  178  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  54.36 
 
 		 151 aa  174  4e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 149 aa  143  1e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  46.31 
 
 		 149 aa  140  8e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  46.91 
 
 		 174 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3286  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1024  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  137  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3091  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 149 aa  137  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  43.95 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  45.27 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  42.68 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1941  transcriptional regulator NrdR  44.23 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2074  transcriptional regulator NrdR  44.23 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3233  transcriptional regulator NrdR  44.23 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464565  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3195  transcriptional regulator NrdR  44.23 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3248  transcriptional regulator NrdR  44.23 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0835  transcriptional regulator NrdR  44.23 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2669  transcriptional regulator NrdR  44.23 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  43.21 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  45.58 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  45.58 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  45.58 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 149 aa  134  5e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  47.74 
 
 		 165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  134  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  134  8e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1380  transcriptional regulator NrdR  43.59 
 
 		 159 aa  133  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  43.95 
 
 		 160 aa  133  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 157 aa  133  9e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  41.5 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  45.64 
 
 		 164 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  43.62 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  43.14 
 
 		 154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1143  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.086063  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  42.95 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  42.95 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2580  transcriptional regulator NrdR  43.59 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3896  transcriptional regulator NrdR  43.59 
 
 		 159 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 149 aa  132  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0701  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 159 aa  131  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165522  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>