More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1056 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1056  ATP-cone domain protein  100 
 
 		 153 aa  314  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  76.67 
 
 		 163 aa  246  9e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23020  transcriptional regulator NrdR  77.18 
 
 		 163 aa  245  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.19394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  74 
 
 		 161 aa  241  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  72.85 
 
 		 167 aa  238  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2431  ATP-cone domain protein  72.85 
 
 		 170 aa  237  4e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1586  transcriptional regulator NrdR  74.66 
 
 		 165 aa  237  5e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393261  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  78.62 
 
 		 160 aa  236  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  73.51 
 
 		 164 aa  230  5e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2426  ATP-cone domain-containing protein  70.83 
 
 		 154 aa  226  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.747365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  69.08 
 
 		 154 aa  225  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  71.72 
 
 		 154 aa  225  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  70 
 
 		 154 aa  224  3e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  70.67 
 
 		 154 aa  224  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1234  transcriptional regulator NrdR  73.79 
 
 		 186 aa  223  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260775  hitchhiker  0.00672311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1508  ATP-cone domain protein  72.41 
 
 		 163 aa  221  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00704462  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7130  ATP-cone domain protein  68.97 
 
 		 153 aa  220  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2443  transcriptional regulator NrdR  68.67 
 
 		 154 aa  219  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624059  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  66.67 
 
 		 157 aa  218  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  68.63 
 
 		 154 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  68.63 
 
 		 154 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  68.63 
 
 		 154 aa  218  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  67.79 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3327  ATP-cone domain protein  68.49 
 
 		 167 aa  218  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  73.72 
 
 		 170 aa  218  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  69.66 
 
 		 151 aa  216  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  68.49 
 
 		 178 aa  213  5.9999999999999996e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  66.89 
 
 		 183 aa  213  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  64 
 
 		 170 aa  213  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  68.28 
 
 		 156 aa  212  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3508  transcriptional regulator NrdR  70.34 
 
 		 181 aa  211  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.130219 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  65.79 
 
 		 161 aa  209  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  64.24 
 
 		 151 aa  207  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17180  transcriptional regulator NrdR  67.12 
 
 		 166 aa  207  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.966193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  63.45 
 
 		 153 aa  203  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3812  ATP-cone domain-containing protein  63.45 
 
 		 172 aa  200  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581101  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  58.67 
 
 		 151 aa  192  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  42.67 
 
 		 150 aa  147  4e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  42.67 
 
 		 153 aa  144  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 153 aa  143  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0063  ATP-cone domain-containing protein  48.3 
 
 		 173 aa  141  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  140  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 173 aa  138  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  40.14 
 
 		 153 aa  137  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1574  ATP-cone domain protein  43.54 
 
 		 154 aa  137  7e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 152 aa  137  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0669  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 		 160 aa  136  7.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.528006  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3913  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 		 160 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275077  normal  0.0858388 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  43.23 
 
 		 156 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  45.1 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  40.94 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 150 aa  135  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 152 aa  135  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  38.82 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0169  putative transcriptional regulator  66.34 
 
 		 102 aa  135  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0650097  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0766  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 		 160 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.449206  normal  0.248117 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  134  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  41.5 
 
 		 157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  44.59 
 
 		 148 aa  134  4e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 153 aa  134  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 154 aa  134  5e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 149 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1051  transcriptional regulator NrdR  41.89 
 
 		 149 aa  133  7.000000000000001e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0419626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 150 aa  133  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 153 aa  133  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  39.47 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  43.54 
 
 		 163 aa  133  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  40.82 
 
 		 151 aa  133  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  43.24 
 
 		 149 aa  133  8e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  40.27 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  44.22 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2448  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 164 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 174 aa  133  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2033  transcriptional regulator NrdR  45.1 
 
 		 150 aa  132  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  41.89 
 
 		 149 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  43.42 
 
 		 153 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  41.89 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3286  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3091  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1024  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  41.22 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  41.89 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  41.89 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  41.5 
 
 		 149 aa  131  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>