More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2033 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2033  transcriptional regulator NrdR  100 
 
 		 150 aa  302  8.000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  68.71 
 
 		 165 aa  211  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0063  ATP-cone domain-containing protein  68.75 
 
 		 173 aa  209  7.999999999999999e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 153 aa  156  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  48.68 
 
 		 158 aa  156  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1608  ATP-cone domain protein  50.68 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000998314  hitchhiker  0.000000000000175991 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 150 aa  153  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  51.7 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  47.37 
 
 		 154 aa  150  4e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  53.06 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 154 aa  148  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 153 aa  147  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1887  ATP-cone domain protein  50.99 
 
 		 176 aa  148  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  52.38 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  51.02 
 
 		 153 aa  147  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  49.34 
 
 		 153 aa  146  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 		 151 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 154 aa  145  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  48.37 
 
 		 158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3491  transcriptional regulator NrdR  47.97 
 
 		 180 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4029  ATP-cone domain protein  49.32 
 
 		 184 aa  144  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292973 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  50.67 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4664  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  45.1 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.280022  decreased coverage  0.00221105 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3049  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000710191  normal  0.330337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3071  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  50.75 
 
 		 160 aa  141  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 156 aa  141  4e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  51.49 
 
 		 160 aa  140  6e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  51.49 
 
 		 160 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3364  transcriptional regulator NrdR  48 
 
 		 185 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.864476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1003  transcriptional regulator NrdR  46.98 
 
 		 156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000818068  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2529  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0537327  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  48.98 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 160 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  45.39 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  44.08 
 
 		 158 aa  138  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2635  transcriptional regulator NrdR  46.71 
 
 		 160 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.436717  normal  0.516899 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  48.03 
 
 		 149 aa  137  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4041  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 163 aa  137  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03461  transcriptional regulator NrdR  44.44 
 
 		 159 aa  137  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  50 
 
 		 183 aa  137  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4648  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 161 aa  137  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183456 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 159 aa  136  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  45.95 
 
 		 159 aa  136  7e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  49.25 
 
 		 157 aa  136  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03371  transcriptional regulator NrdR  44.44 
 
 		 159 aa  136  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  49.32 
 
 		 177 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03481  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 157 aa  136  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0630  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 160 aa  136  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.189278  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0789  transcriptional regulator NrdR  47.18 
 
 		 155 aa  136  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0165247  normal  0.0364138 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  43.42 
 
 		 155 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3493  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.466621  normal  0.949601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  50.66 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  46.05 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  45.39 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03381  transcriptional regulator NrdR  44.44 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.36226  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3169  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 185 aa  136  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.129734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0817  transcriptional regulator NrdR  49.29 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218804  normal  0.43356 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1376  transcriptional regulator NrdR  43.92 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 156 aa  134  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  48.3 
 
 		 155 aa  135  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  52.78 
 
 		 170 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  47.86 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0319  transcriptional regulator NrdR  43.14 
 
 		 159 aa  134  5e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  46.62 
 
 		 150 aa  134  5e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1866  transcriptional regulator NrdR  44.74 
 
 		 158 aa  133  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.610385  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  41.5 
 
 		 153 aa  133  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  50 
 
 		 182 aa  133  7.000000000000001e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  49.66 
 
 		 163 aa  133  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  44.59 
 
 		 157 aa  133  8e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  49.32 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  41.5 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  41.5 
 
 		 156 aa  133  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  46.36 
 
 		 186 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0768  ATP-cone domain protein  45.58 
 
 		 148 aa  133  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.376123  normal  0.291011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  45.33 
 
 		 151 aa  132  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1056  ATP-cone domain protein  45.1 
 
 		 153 aa  132  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4090  ATP-cone domain protein  47.06 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  47.65 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  47.62 
 
 		 150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  46.62 
 
 		 151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>