More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0169 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0169  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 102 aa  202  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0650097  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  73 
 
 		 151 aa  153  7e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  68.32 
 
 		 153 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  69 
 
 		 161 aa  141  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  70 
 
 		 163 aa  140  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  67 
 
 		 160 aa  136  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2426  ATP-cone domain-containing protein  65 
 
 		 154 aa  135  2e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.747365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1056  ATP-cone domain protein  66.34 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23020  transcriptional regulator NrdR  66 
 
 		 163 aa  134  4e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.19394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3508  transcriptional regulator NrdR  67 
 
 		 181 aa  134  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.130219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1586  transcriptional regulator NrdR  66.34 
 
 		 165 aa  133  7.000000000000001e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393261  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3327  ATP-cone domain protein  62.75 
 
 		 167 aa  133  8e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2431  ATP-cone domain protein  65 
 
 		 170 aa  132  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1234  transcriptional regulator NrdR  67 
 
 		 186 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260775  hitchhiker  0.00672311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7130  ATP-cone domain protein  63.37 
 
 		 153 aa  131  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  65.35 
 
 		 156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  61.76 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  62.38 
 
 		 157 aa  130  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  62.38 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  60.78 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  65.35 
 
 		 167 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  67.71 
 
 		 170 aa  129  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  64.36 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  66 
 
 		 151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17180  transcriptional regulator NrdR  62.38 
 
 		 166 aa  128  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.966193 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  64.36 
 
 		 154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  62.38 
 
 		 183 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1508  ATP-cone domain protein  63 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00704462  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  63 
 
 		 164 aa  123  7e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  61.39 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2443  transcriptional regulator NrdR  61.39 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624059  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  60.4 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  61.39 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  59.41 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  61.39 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  61.39 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3812  ATP-cone domain-containing protein  61 
 
 		 172 aa  119  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581101  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  58.82 
 
 		 178 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  40.59 
 
 		 150 aa  92  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  45.54 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1418  transcriptional regulator NrdR  42.42 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000085641  hitchhiker  0.00000000000128798 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  45.65 
 
 		 153 aa  87.8  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  45.65 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  45.65 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  45.65 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  45.65 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  45.65 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  45.65 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  45.65 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  45.65 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  45.65 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4411  transcriptional regulator NrdR  45.65 
 
 		 153 aa  87  7e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000407341  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  42.57 
 
 		 174 aa  85.9  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1777  transcriptional regulator NrdR  38.38 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1743  transcriptional regulator NrdR  38.38 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  36.36 
 
 		 151 aa  84.3  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  41.84 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  37.37 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2875  transcriptional regulator NrdR  44.79 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.362854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  37.37 
 
 		 149 aa  84  7e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  41.41 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  43.3 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  44.44 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0669  ATP-cone domain protein  47.47 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.528006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1249  transcriptional regulator NrdR  37.37 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0638697  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  42.57 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  39.39 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  41.24 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0177  ATP-cone domain-containing protein  41.41 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  40.82 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  39.8 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1690  transcriptional regulator NrdR  36.73 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04031  transcriptional regulator NrdR  36.73 
 
 		 159 aa  80.5  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.5904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  39.8 
 
 		 150 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22151  transcriptional regulator NrdR  38.38 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  40.59 
 
 		 152 aa  80.1  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07390  transcriptional regulator NrdR  41.41 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000000247789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  38.78 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0949  hypothetical protein  39.6 
 
 		 150 aa  79.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000456921  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0356  transcriptional regulator NrdR  39.78 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016324  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  41.84 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  38.78 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2660  transcriptional regulator NrdR  40.4 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.258967  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1886  ATP-cone domain protein  43.3 
 
 		 183 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  39.39 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1826  transcriptional regulator NrdR  39.39 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0898017  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3005  transcriptional regulator NrdR  40.4 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.196155  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1726  transcriptional regulator NrdR  39.39 
 
 		 160 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.222643  normal  0.114234 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10820  transcriptional regulator NrdR  42 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000786411  unclonable  0.00000000140885 
 
 
-
 
NC_004310  BR0766  transcriptional regulator NrdR  42.42 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3091  transcriptional regulator NrdR  41.18 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0759  transcriptional regulator NrdR  42.42 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2672  transcriptional regulator NrdR  40.4 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0812854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  41.24 
 
 		 155 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0125  transcriptional regulator NrdR  36.46 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.69395  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  41.41 
 
 		 176 aa  77  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1024  transcriptional regulator NrdR  40.2 
 
 		 149 aa  76.3  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01165  hypothetical protein  38.14 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1815  transcriptional regulator NrdR  39.39 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>