More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3977 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3977  ATP-cone domain protein  100 
 
 		 178 aa  351  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.173663 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12732  transcriptional regulator NrdR  78.62 
 
 		 154 aa  237  6.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.810136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1410  transcriptional regulator NrdR  77.93 
 
 		 154 aa  237  8e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0529777  decreased coverage  0.0000016727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1452  transcriptional regulator NrdR  77.24 
 
 		 154 aa  236  9e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.711361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3954  transcriptional regulator NrdR  75.86 
 
 		 154 aa  231  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.564553  normal  0.678519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2443  transcriptional regulator NrdR  75.86 
 
 		 154 aa  231  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.624059  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27580  transcriptional regulator NrdR  73.97 
 
 		 161 aa  229  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2159  transcriptional regulator NrdR  76.55 
 
 		 154 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182099  hitchhiker  0.00422331 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2170  transcriptional regulator NrdR  76.55 
 
 		 154 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.227805  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2216  transcriptional regulator NrdR  76.55 
 
 		 154 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.152873  normal  0.135951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4561  ATP-cone domain-containing protein  71.43 
 
 		 156 aa  228  5e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.353227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1432  ATP-cone domain protein  73.79 
 
 		 151 aa  224  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0103266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3327  ATP-cone domain protein  71.92 
 
 		 167 aa  220  8e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2426  ATP-cone domain-containing protein  72.22 
 
 		 154 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.747365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7130  ATP-cone domain protein  71.72 
 
 		 153 aa  219  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1585  ATP-cone domain protein  71.03 
 
 		 157 aa  218  3e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1477  ribonucleotide reductase regulator NrdR-like  71.81 
 
 		 170 aa  218  3e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.000394514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3899  ATP-cone domain protein  67.53 
 
 		 183 aa  218  3e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2224  ATP-cone domain protein  69.62 
 
 		 170 aa  218  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1234  transcriptional regulator NrdR  63.07 
 
 		 186 aa  216  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.260775  hitchhiker  0.00672311 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2431  ATP-cone domain protein  65 
 
 		 170 aa  215  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1260  ATP-cone domain protein  65.22 
 
 		 161 aa  215  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0123443  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1056  ATP-cone domain protein  68.49 
 
 		 153 aa  214  8e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23020  transcriptional regulator NrdR  64.78 
 
 		 163 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.19394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1810  ATP-cone domain protein  67.79 
 
 		 156 aa  210  7e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.281201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1586  transcriptional regulator NrdR  61.27 
 
 		 165 aa  210  7.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.393261  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2150  transcriptional regulator NrdR  67.55 
 
 		 153 aa  209  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0932637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1586  transcriptional regulator NrdR  68.03 
 
 		 167 aa  209  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00003424 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3508  transcriptional regulator NrdR  68 
 
 		 181 aa  207  9e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.130219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1815  ATP-cone domain protein  66.9 
 
 		 151 aa  203  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0440431  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1569  ATP-cone domain protein  62.05 
 
 		 163 aa  203  9e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.641759  hitchhiker  0.00205986 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10640  transcriptional regulator NrdR  67.35 
 
 		 160 aa  203  9e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.793726  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13480  transcriptional regulator, NrdR family  66.89 
 
 		 164 aa  203  1e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3812  ATP-cone domain-containing protein  55.06 
 
 		 172 aa  193  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.581101  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1508  ATP-cone domain protein  60.12 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00704462  normal  0.166758 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17180  transcriptional regulator NrdR  57.59 
 
 		 166 aa  181  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.966193 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0575  transcriptional regulator NrdR  53.79 
 
 		 151 aa  173  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0494277 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0279  transcriptional regulator NrdR  45.4 
 
 		 174 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00520187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  45.75 
 
 		 163 aa  144  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0063  ATP-cone domain-containing protein  45.2 
 
 		 173 aa  143  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.987989 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  42.67 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1623  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  143  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000406382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  47.4 
 
 		 162 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2743  transcriptional regulator NrdR  47.06 
 
 		 156 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2184  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  141  4e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000132804  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2725  transcriptional regulator NrdR  43.71 
 
 		 153 aa  141  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000561851  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2665  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 153 aa  141  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00143728  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0042  ATP-cone domain protein  48.34 
 
 		 165 aa  141  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.67036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2835  transcriptional regulator NrdR  47.02 
 
 		 155 aa  141  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0802183  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1597  transcriptional regulator NrdR  44.22 
 
 		 150 aa  140  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000000794729  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2927  transcriptional regulator NrdR  47.02 
 
 		 155 aa  140  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  140  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  140  9e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  140  9e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  140  9e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1225  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.123121 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3025  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.304834  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1200  ATP-cone domain protein  43.33 
 
 		 155 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  45.58 
 
 		 150 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1244  transcriptional regulator NrdR  43.54 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000621144  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1687  transcriptional regulator NrdR  46.26 
 
 		 150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  44.9 
 
 		 157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  39.07 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  42.18 
 
 		 151 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  45.83 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  138  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 173 aa  138  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  42.86 
 
 		 153 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3046  transcriptional regulator NrdR  48.23 
 
 		 157 aa  138  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.212603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1070  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 		 150 aa  137  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000102337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0692  transcriptional regulator NrdR  46.94 
 
 		 158 aa  137  7e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.663246  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  45.14 
 
 		 149 aa  137  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2059  transcriptional regulator NrdR  40.82 
 
 		 154 aa  137  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000239578  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  44.97 
 
 		 149 aa  136  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  41.33 
 
 		 153 aa  136  1e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3251  transcriptional regulator NrdR  44.67 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  45.14 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 149 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  42.38 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  39.86 
 
 		 150 aa  135  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1132  transcriptional regulator NrdR  50.71 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.26106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2012  transcriptional regulator NrdR  40.82 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.37372  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1998  transcriptional regulator NrdR  38.78 
 
 		 158 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000130508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0989  transcriptional regulator NrdR  48.51 
 
 		 152 aa  135  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  44.3 
 
 		 149 aa  135  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1730  transcriptional regulator NrdR  40.14 
 
 		 149 aa  135  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0593738  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4690  transcriptional regulator NrdR  42.38 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000176675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4711  transcriptional regulator NrdR  42.38 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000383164  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4695  transcriptional regulator NrdR  42.38 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.91866e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4476  transcriptional regulator NrdR  42.38 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000265338  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4311  transcriptional regulator NrdR  42.38 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.8117699999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4322  transcriptional regulator NrdR  42.38 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178124  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1510  transcriptional regulator NrdR  36.73 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4824  transcriptional regulator NrdR  42.38 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000114279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4705  transcriptional regulator NrdR  42.38 
 
 		 153 aa  134  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000119407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>