More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1886 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1886  ATP-cone domain protein  100 
 
 		 183 aa  363  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.428918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1558  ATP-cone domain protein  62.2 
 
 		 172 aa  200  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.609001  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11380  transcriptional regulator NrdR  56.08 
 
 		 154 aa  164  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.165423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1044  transcriptional regulator NrdR  56.08 
 
 		 175 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1659  transcriptional regulator NrdR  55.63 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.242165  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1401  transcriptional regulator NrdR  53.38 
 
 		 154 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.124878  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0578  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 		 157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1579  transcriptional regulator NrdR  53.02 
 
 		 157 aa  161  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000136219  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06700  transcriptional regulator NrdR  56.08 
 
 		 154 aa  161  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0842  ATP-cone domain-containing protein  54.05 
 
 		 172 aa  161  6e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02986  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 		 149 aa  160  8.000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000784776  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1870  ATP-cone domain protein  53.64 
 
 		 175 aa  160  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0173764  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0513  transcriptional regulator NrdR  56.08 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579451  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0689  hypothetical protein  54.73 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3091  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 		 149 aa  159  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.441294  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5020  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0548  transcriptional regulator NrdR  56.08 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0374  transcriptional regulator NrdR  55.7 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233344  normal  0.151767 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0559  transcriptional regulator NrdR  56.08 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4051  ATP-cone domain-containing protein  53.69 
 
 		 170 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4463  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 154 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3858  transcriptional regulator NrdR  54.73 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0566  transcriptional regulator NrdR  55.41 
 
 		 154 aa  157  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00361  hypothetical protein  54.67 
 
 		 149 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.489757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3196  ATP-cone domain protein  54.67 
 
 		 149 aa  157  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.226098  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00365  hypothetical protein  54.67 
 
 		 149 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.376997  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0444  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 		 149 aa  157  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0495  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 		 149 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.858521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0449  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 		 149 aa  157  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0484  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 		 149 aa  157  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3286  transcriptional regulator NrdR  52.67 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3220  transcriptional regulator NrdR  54.67 
 
 		 149 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108908 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1015  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 149 aa  157  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1310  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 149 aa  156  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1051  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 		 149 aa  156  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0419626  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1024  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 149 aa  155  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3459  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 156 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.007384 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0462  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 		 149 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0456  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 		 149 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0454  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 		 149 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0517  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 		 149 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0475  transcriptional regulator NrdR  53.33 
 
 		 149 aa  155  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0729  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 165 aa  154  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3470  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2026  transcriptional regulator NrdR  53.75 
 
 		 174 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2779  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.392187  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1095  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.287796  normal  0.608767 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1161  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.860678  normal  0.127116 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1034  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0182985  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1095  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146085  normal  0.938869 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0334  transcriptional regulator NrdR  54 
 
 		 149 aa  154  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.402323  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1439  ATP-cone domain-containing protein  49.34 
 
 		 151 aa  154  6e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2900  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 149 aa  154  9e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.708729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3304  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.311833  hitchhiker  0.000761879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3160  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.166441  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1186  transcriptional regulator NrdR  50.99 
 
 		 157 aa  153  1e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.526679  normal  0.888378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1071  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 149 aa  153  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.472866  hitchhiker  0.0011429 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3161  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.769122  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1210  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.665936 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004266  ribonucleotide reductase transcriptional regulator NrdR  50.67 
 
 		 149 aa  151  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000298691  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1272  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  151  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00612779  hitchhiker  0.000000016525 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1161  transcriptional regulator NrdR  51.01 
 
 		 149 aa  151  5e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000702599  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1381  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00201754  hitchhiker  0.0000201211 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3162  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 149 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0901  transcriptional regulator NrdR  55.7 
 
 		 155 aa  150  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3118  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 149 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.125691  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3259  transcriptional regulator NrdR  52 
 
 		 149 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.231243  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0881  transcriptional regulator NrdR  51.33 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1143  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.086063  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0921  transcriptional regulator NrdR  50.34 
 
 		 149 aa  149  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1862  transcriptional regulator NrdR  50 
 
 		 149 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00283574  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0280  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 148 aa  147  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1916  transcriptional regulator NrdR  48.99 
 
 		 148 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109588  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0763  transcriptional regulator NrdR  47.68 
 
 		 155 aa  143  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1444  transcriptional regulator NrdR  48.94 
 
 		 157 aa  143  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2586  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 161 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0792  transcriptional regulator NrdR  47.68 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0005  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1156  transcriptional regulator NrdR  47.02 
 
 		 153 aa  142  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5296  transcriptional regulator NrdR  49.67 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3103  transcriptional regulator NrdR  51.68 
 
 		 186 aa  141  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  hitchhiker  0.00872195  normal  0.010624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3957  ATP-cone domain-containing protein  49.34 
 
 		 177 aa  141  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0864731 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1549  ATP-cone domain protein  53.02 
 
 		 163 aa  141  6e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000415369  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0604  transcriptional regulator NrdR  49.66 
 
 		 154 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0576  transcriptional regulator NrdR  46.2 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09190  ATP-cone domain protein  45.95 
 
 		 151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000241232  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2109  ATP-cone domain protein  48.39 
 
 		 176 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1748  transcriptional regulator NrdR  49.65 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0805744  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0157  transcriptional regulator NrdR  44 
 
 		 150 aa  139  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0450  transcriptional regulator NrdR  48.32 
 
 		 151 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00111  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4277  ATP-cone domain-containing protein  48.43 
 
 		 182 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497117  normal  0.0160175 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0048  ATP-cone domain protein  47.97 
 
 		 158 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2939  transcriptional regulator NrdR  47.95 
 
 		 147 aa  136  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.634156 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0308  transcriptional regulator NrdR  47.65 
 
 		 148 aa  135  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.816835  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0728  transcriptional regulator NrdR  45.89 
 
 		 149 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.443303 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2732  transcriptional regulator NrdR  49.32 
 
 		 162 aa  135  4e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1697  transcriptional regulator NrdR  44.37 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0793  transcriptional regulator NrdR  48.65 
 
 		 153 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3266  transcriptional regulator NrdR  48.39 
 
 		 153 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000209294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0548  transcriptional regulator NrdR  48.39 
 
 		 153 aa  134  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000060118  unclonable  2.0296800000000001e-26 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>