103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3498 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3498  transcription antitermination protein nusG  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0887  transcription antitermination protein nusG  37.65 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.769632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3605  NusG antitermination factor  32.28 
 
 		 174 aa  97.8  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358379  hitchhiker  0.000423635 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5306  NusG antitermination factor  34.18 
 
 		 174 aa  94  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955236  normal  0.0968328 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3892  NGN domain protein  28.66 
 
 		 176 aa  86.3  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0149  NusG antitermination factor  32.94 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.114969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  34.12 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0965  NusG antitermination factor  32.9 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2594  transcription antitermination protein nusG  33.53 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000665583  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1511  NusG antitermination factor  35.03 
 
 		 172 aa  77  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0546  NGN domain protein  28.95 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00381555 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  30.56 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0626  NusG antitermination factor  33.74 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000497813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1589  NusG antitermination factor  32.9 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.262291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5198  NusG antitermination factor  28.92 
 
 		 170 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.296838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2672  transcriptional activator RfaH  27.54 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000489964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0357  NusG antitermination factor  24.83 
 
 		 154 aa  72  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1665  NusG antitermination factor  31.85 
 
 		 170 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2360  NusG antitermination factor  31.82 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00889306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3398  NusG antitermination factor  25.7 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.191132  normal  0.539584 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1374  transcription antitermination protein nusG  26.47 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000814975  hitchhiker  0.00000420235 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3036  transcriptional acivator RfaH  27.33 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00758207  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2844  NusG antitermination factor  27.06 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.117724  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2894  transcriptional acivator RfaH  26.71 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000245267  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2904  transcriptional acivator RfaH  27.33 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1469  transcriptional acivator RfaH  27.33 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000410204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1394  transcriptional acivator RfaH  26.79 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0133861  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1650  transcriptional acivator RfaH  28.32 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0204524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1314  transcription antitermination protein nusG  25.93 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0397005  normal  0.368263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1381  transcription antitermination protein nusG  25.93 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111282  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2265  NusG antitermination factor  29.01 
 
 		 175 aa  64.3  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2544  NusG antitermination factor  26.11 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3638  NusG antitermination factor  30.54 
 
 		 180 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2812  transcription antitermination protein nusG  31.65 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194  transcriptional activator rfaH, putative  25.16 
 
 		 166 aa  62  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2660  NusG antitermination factor  26.22 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192124  normal  0.041125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3033  NusG antitermination factor  26.04 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201282  hitchhiker  0.00738104 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1705  NusG antitermination factor  30.06 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0707648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6306  NusG antitermination factor  27.89 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.343168 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3466  NusG antitermination factor  25.19 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3226  transcriptional activator RfaH  29.61 
 
 		 170 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1124  transcriptional activator RfaH  27.27 
 
 		 167 aa  57  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0891  transcriptional activator  26.83 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1398  NusG antitermination factor  25.29 
 
 		 175 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000128095  normal  0.158725 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01331  transcriptional activator RfaH  27.44 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2265  transcriptional activator rfaH, putative  24.52 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000106043  hitchhiker  0.00695369 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0191  NusG antitermination factor  29.34 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.0000000382089  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0228  transcription antitermination protein nusG  29.24 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00207828  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3444  transcriptional activator RfaH  30.41 
 
 		 170 aa  52  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2684  NusG antitermination factor  28.74 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000736005  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  25.71 
 
 		 181 aa  51.6  0.000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  28.57 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  28.57 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  28.57 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  27.12 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2484  transcriptional activator RfaH  26.58 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0283  NusG antitermination factor  28.99 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000819878  hitchhiker  0.00383281 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  25.86 
 
 		 176 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  26.32 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  25.73 
 
 		 183 aa  48.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0093  transcription antitermination protein nusG  25.61 
 
 		 177 aa  48.1  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  26.97 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3134  NusG antitermination factor  30.91 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2398  NusG antitermination factor  31.58 
 
 		 196 aa  47.4  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.134344  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004133  transcriptional activator RfaH  25 
 
 		 166 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0314  NusG antitermination factor  28.24 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000044126  decreased coverage  0.000127563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  25 
 
 		 178 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1967  NusG antitermination factor  25.41 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.688216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  30.23 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000027375  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  23.35 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  23.64 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0826  transcriptional activator RfaH  23.27 
 
 		 165 aa  45.1  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  24.1 
 
 		 178 aa  44.7  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  25.13 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  29.65 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  24.42 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  27.68 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2406  transcription antitermination protein NusG  26.47 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337578  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  24.39 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  23.03 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  23.64 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  24.62 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  24.39 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  23.21 
 
 		 176 aa  43.5  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  24.86 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0204  NusG antitermination factor  28.32 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  23.03 
 
 		 176 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4226  NusG antitermination factor  27.75 
 
 		 164 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.841034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  28.39 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  23.03 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2142  transcription antitermination protein nusG  27.21 
 
 		 182 aa  42.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.592011  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  25.75 
 
 		 179 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1375  NusG antitermination factor  32.65 
 
 		 176 aa  42  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078055  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  24.29 
 
 		 178 aa  42  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0352  NusG antitermination factor  25.15 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000459133  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4091  hypothetical protein  25.61 
 
 		 174 aa  42  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.177028 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  22.75 
 
 		 176 aa  42  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  24.85 
 
 		 175 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15910  transcriptional activator RfaH  27.34 
 
 		 153 aa  42  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  25 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>