More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2406 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2406  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337578  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  62.92 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000027375  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  62.36 
 
 		 179 aa  238  4e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  54.29 
 
 		 183 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  52.54 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  48.35 
 
 		 192 aa  174  5e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  50.29 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 177 aa  167  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  50.29 
 
 		 182 aa  167  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  50.29 
 
 		 182 aa  167  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  46.59 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  50.29 
 
 		 175 aa  165  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  49.14 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  50.28 
 
 		 175 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  44.94 
 
 		 181 aa  156  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  45.2 
 
 		 174 aa  155  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  49.43 
 
 		 177 aa  155  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  48.86 
 
 		 177 aa  155  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  46.24 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  45.45 
 
 		 175 aa  152  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  46.24 
 
 		 194 aa  152  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  48.28 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  45.98 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  48.3 
 
 		 176 aa  148  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  48.85 
 
 		 175 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  47.98 
 
 		 175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  45.66 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  45.66 
 
 		 173 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  43.93 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  41.94 
 
 		 266 aa  144  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  41.18 
 
 		 306 aa  142  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  43.09 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  42.94 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  45.45 
 
 		 199 aa  141  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  43.35 
 
 		 178 aa  141  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  42.54 
 
 		 193 aa  140  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  43.5 
 
 		 277 aa  141  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  42.94 
 
 		 273 aa  140  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  42.37 
 
 		 188 aa  140  9e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  43.48 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  38.19 
 
 		 280 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  40.46 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  42.93 
 
 		 242 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  41.49 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  41.5 
 
 		 276 aa  138  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  39.29 
 
 		 269 aa  138  4.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  137  7e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  40.44 
 
 		 266 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  40.96 
 
 		 185 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  39.67 
 
 		 250 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  41.57 
 
 		 177 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  44.44 
 
 		 174 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  42.29 
 
 		 199 aa  137  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  42.29 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  36.87 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  42.29 
 
 		 177 aa  136  2e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  41.14 
 
 		 198 aa  136  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  40.22 
 
 		 238 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  41.11 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  43.41 
 
 		 177 aa  135  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  39.09 
 
 		 266 aa  135  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  40.68 
 
 		 192 aa  134  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  39.3 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  38.89 
 
 		 185 aa  135  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  45.05 
 
 		 228 aa  134  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  40 
 
 		 272 aa  134  9e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  42.61 
 
 		 190 aa  133  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  38.97 
 
 		 272 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  38.76 
 
 		 178 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  39.31 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  39.33 
 
 		 203 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  37.44 
 
 		 198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  41.62 
 
 		 273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  38.66 
 
 		 299 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  40.57 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  37.95 
 
 		 238 aa  132  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  39.78 
 
 		 196 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>