More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2954 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  100 
 
 
198 aa  397  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0520  NusG antitermination factor  50 
 
 
190 aa  191  5e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  45.26 
 
 
175 aa  185  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  47.12 
 
 
175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  48.17 
 
 
175 aa  180  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  46.07 
 
 
174 aa  179  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  46.91 
 
 
178 aa  178  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  46.07 
 
 
175 aa  175  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  47.12 
 
 
175 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  44.9 
 
 
181 aa  171  7.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  43.46 
 
 
203 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  46.32 
 
 
181 aa  170  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  48.42 
 
 
176 aa  170  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  42.63 
 
 
187 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  43.75 
 
 
182 aa  168  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  43.75 
 
 
182 aa  168  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  43.23 
 
 
182 aa  167  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  44.9 
 
 
177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  41.05 
 
 
194 aa  165  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  41.05 
 
 
194 aa  165  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  41.71 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  44.68 
 
 
201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  45.88 
 
 
177 aa  159  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  43.37 
 
 
266 aa  158  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  46.32 
 
 
177 aa  157  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  44.62 
 
 
185 aa  157  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  44.04 
 
 
183 aa  157  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  39.29 
 
 
238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  41.92 
 
 
272 aa  154  9e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  38.78 
 
 
250 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  40.53 
 
 
180 aa  153  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  43.92 
 
 
173 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  43.92 
 
 
173 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  39.9 
 
 
192 aa  153  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  44.68 
 
 
174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  40.62 
 
 
266 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  44.21 
 
 
172 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  43.55 
 
 
185 aa  152  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  40.21 
 
 
243 aa  152  4e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  40.76 
 
 
276 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  42.36 
 
 
272 aa  151  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  42.65 
 
 
271 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  42.65 
 
 
270 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  42.65 
 
 
270 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  41.75 
 
 
273 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  40 
 
 
177 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  41.67 
 
 
299 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  41.71 
 
 
265 aa  149  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  41.09 
 
 
280 aa  149  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  40.29 
 
 
267 aa  149  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  42.23 
 
 
266 aa  149  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  40.59 
 
 
273 aa  148  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  43.01 
 
 
176 aa  148  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  44.33 
 
 
177 aa  148  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  42.36 
 
 
238 aa  148  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  37.37 
 
 
185 aa  147  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  44.33 
 
 
177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  44.33 
 
 
177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  38.62 
 
 
188 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  44.33 
 
 
177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  44.33 
 
 
177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  44.33 
 
 
177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  39.79 
 
 
176 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  44.33 
 
 
177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  44.33 
 
 
177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  40.43 
 
 
172 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  39.58 
 
 
197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  44.33 
 
 
177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  41.49 
 
 
277 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  39.79 
 
 
176 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  40.41 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  39.27 
 
 
176 aa  145  3e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  40.84 
 
 
176 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  38.58 
 
 
185 aa  145  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  38 
 
 
199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  38.02 
 
 
196 aa  144  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  38.02 
 
 
196 aa  144  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  37.7 
 
 
177 aa  145  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  43.81 
 
 
177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  38.3 
 
 
177 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  41.45 
 
 
178 aa  144  7.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  40.69 
 
 
296 aa  144  7.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  36.65 
 
 
176 aa  144  8.000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  38.95 
 
 
194 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  39.36 
 
 
173 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  39.06 
 
 
242 aa  144  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  38.95 
 
 
194 aa  143  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  39.27 
 
 
177 aa  143  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  38.54 
 
 
242 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  39.79 
 
 
176 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  39.06 
 
 
177 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  40.1 
 
 
306 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  38.74 
 
 
177 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  39.36 
 
 
177 aa  143  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  41.12 
 
 
301 aa  142  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  38.22 
 
 
176 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  36.65 
 
 
176 aa  142  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0560  transcription antitermination protein nusG  38.95 
 
 
177 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  41.71 
 
 
287 aa  142  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  38.66 
 
 
180 aa  142  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>