More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_08690 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  100 
 
 		 178 aa  359  1e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  80.9 
 
 		 176 aa  297  7e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  74.72 
 
 		 178 aa  278  3e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  66.11 
 
 		 181 aa  255  2e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  56.57 
 
 		 201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  51.87 
 
 		 306 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  55.68 
 
 		 194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  52.72 
 
 		 266 aa  193  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  54.55 
 
 		 194 aa  193  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  56.18 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  50.27 
 
 		 266 aa  191  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  50.85 
 
 		 243 aa  191  5e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  50.79 
 
 		 267 aa  191  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  52.54 
 
 		 177 aa  187  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  50.57 
 
 		 176 aa  187  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  53.59 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  53.71 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  50.56 
 
 		 175 aa  185  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  51.65 
 
 		 246 aa  185  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  52.25 
 
 		 175 aa  184  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  51.96 
 
 		 273 aa  184  6e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  50 
 
 		 175 aa  184  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  51.96 
 
 		 277 aa  183  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  50.29 
 
 		 173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  50.29 
 
 		 203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  48.17 
 
 		 272 aa  181  6e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  51.1 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  50 
 
 		 187 aa  180  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  49.72 
 
 		 177 aa  180  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  49.72 
 
 		 176 aa  180  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  47.64 
 
 		 272 aa  179  1e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  51.14 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  49.2 
 
 		 265 aa  179  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  48.66 
 
 		 280 aa  178  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  48.07 
 
 		 238 aa  178  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  51.14 
 
 		 177 aa  178  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  48.91 
 
 		 250 aa  177  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  50.57 
 
 		 177 aa  177  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  47.94 
 
 		 266 aa  177  8e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  49.44 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  49.44 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 177 aa  176  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  47.4 
 
 		 270 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  47.4 
 
 		 270 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  47.4 
 
 		 271 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  48.6 
 
 		 177 aa  176  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  49.18 
 
 		 273 aa  175  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  48.04 
 
 		 177 aa  174  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  48.31 
 
 		 177 aa  174  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  52.81 
 
 		 175 aa  174  5e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  48.6 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  49.72 
 
 		 179 aa  174  6e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  48.6 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  48.04 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  48.04 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  48.6 
 
 		 177 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  47.85 
 
 		 301 aa  174  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  48.6 
 
 		 177 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  46.67 
 
 		 276 aa  173  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  50.27 
 
 		 185 aa  173  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  46.07 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  48.89 
 
 		 242 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  50.81 
 
 		 185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  49.44 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  48.59 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  49.16 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  48.96 
 
 		 299 aa  172  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  49.16 
 
 		 179 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  47.51 
 
 		 178 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  47.64 
 
 		 238 aa  171  5e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  54.29 
 
 		 177 aa  171  5e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  48.9 
 
 		 228 aa  171  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  49.15 
 
 		 175 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  45.7 
 
 		 273 aa  171  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  48.33 
 
 		 242 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  49.15 
 
 		 175 aa  170  7.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  49.44 
 
 		 182 aa  170  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  49.44 
 
 		 182 aa  170  9e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  53.14 
 
 		 172 aa  170  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  42.7 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  48.59 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  46.89 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  42.7 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  48.89 
 
 		 182 aa  169  3e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4288  NusG antitermination factor  47.19 
 
 		 177 aa  168  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000127222  hitchhiker  0.00000238714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  46.37 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  46.89 
 
 		 182 aa  168  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  47.19 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  44.32 
 
 		 178 aa  168  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  48.59 
 
 		 175 aa  168  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  44.38 
 
 		 176 aa  167  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  46.63 
 
 		 296 aa  168  5e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  48.59 
 
 		 175 aa  168  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  47.43 
 
 		 199 aa  167  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  50.56 
 
 		 262 aa  167  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  44.38 
 
 		 176 aa  167  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  51.65 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  42.7 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 		 185 aa  166  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  43.26 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>