More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2687 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  100 
 
 		 185 aa  373  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  82.7 
 
 		 185 aa  319  1.9999999999999998e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  65.79 
 
 		 190 aa  240  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  52.25 
 
 		 175 aa  197  7.999999999999999e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  57.14 
 
 		 181 aa  194  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  53.3 
 
 		 175 aa  191  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  50.55 
 
 		 175 aa  188  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  50.55 
 
 		 188 aa  187  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  51.58 
 
 		 266 aa  187  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  55.87 
 
 		 174 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  49.44 
 
 		 187 aa  183  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  51.65 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  50.52 
 
 		 306 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 		 273 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  49.24 
 
 		 272 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  50.54 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  49.44 
 
 		 194 aa  181  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  50 
 
 		 194 aa  181  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 		 177 aa  181  6e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  52.15 
 
 		 250 aa  179  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  51.96 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  49.44 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  49.24 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  49.45 
 
 		 174 aa  179  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  49.75 
 
 		 266 aa  179  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  49.2 
 
 		 266 aa  178  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  50.28 
 
 		 277 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  51.96 
 
 		 176 aa  178  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  50.81 
 
 		 176 aa  177  5.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  48.7 
 
 		 265 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  49.46 
 
 		 238 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  49.46 
 
 		 175 aa  177  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  47.98 
 
 		 271 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  47.98 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  50 
 
 		 180 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  47.98 
 
 		 270 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  47.94 
 
 		 267 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  47.74 
 
 		 276 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  46.5 
 
 		 272 aa  175  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  45.41 
 
 		 178 aa  174  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  48.09 
 
 		 181 aa  173  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  50.55 
 
 		 177 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  49.17 
 
 		 199 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  47.49 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  50.81 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  50.55 
 
 		 175 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  47.31 
 
 		 177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  49.2 
 
 		 242 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  49.73 
 
 		 242 aa  171  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  48.47 
 
 		 299 aa  171  7.999999999999999e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  47.85 
 
 		 177 aa  170  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  47.85 
 
 		 243 aa  170  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  47.83 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  47.87 
 
 		 273 aa  169  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  50.28 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  46.88 
 
 		 280 aa  168  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  49.73 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  47.31 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  50.28 
 
 		 177 aa  168  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  49.2 
 
 		 246 aa  167  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  50.27 
 
 		 177 aa  167  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  50.83 
 
 		 182 aa  167  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  50.83 
 
 		 182 aa  167  7e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  50.83 
 
 		 182 aa  167  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  46.46 
 
 		 296 aa  167  9e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  49.18 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  51.61 
 
 		 262 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  52.41 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  44.44 
 
 		 317 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  50.27 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  48.09 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  48.39 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  48.39 
 
 		 177 aa  165  4e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  46.96 
 
 		 179 aa  165  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  45.86 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  47.75 
 
 		 173 aa  164  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  47.8 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  45.41 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  49.16 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  48.63 
 
 		 177 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  48.63 
 
 		 177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  48.63 
 
 		 177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>