More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3693 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  98.3 
 
 		 176 aa  351  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  97.73 
 
 		 176 aa  350  5e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  98.3 
 
 		 176 aa  350  7e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  96.02 
 
 		 176 aa  348  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  97.16 
 
 		 176 aa  347  6e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  94.22 
 
 		 185 aa  333  7e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  86.93 
 
 		 176 aa  323  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  80.68 
 
 		 176 aa  297  4e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  80.11 
 
 		 176 aa  297  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  80.79 
 
 		 177 aa  294  4e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  80.79 
 
 		 177 aa  294  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  80.79 
 
 		 177 aa  294  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  77.84 
 
 		 176 aa  294  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  80.79 
 
 		 177 aa  294  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  77.84 
 
 		 176 aa  292  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  78.98 
 
 		 176 aa  291  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  77.84 
 
 		 176 aa  291  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  77.84 
 
 		 176 aa  291  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  79.66 
 
 		 177 aa  291  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  79.55 
 
 		 177 aa  288  3e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  74.43 
 
 		 175 aa  279  1e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  74.43 
 
 		 175 aa  279  1e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  79.65 
 
 		 174 aa  279  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  73.86 
 
 		 175 aa  276  8e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  74.57 
 
 		 185 aa  276  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  71.02 
 
 		 176 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  67.61 
 
 		 176 aa  264  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  68.18 
 
 		 176 aa  262  2e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  65.91 
 
 		 177 aa  255  3e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  66.48 
 
 		 176 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  60.23 
 
 		 176 aa  233  8e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  64.2 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  62.29 
 
 		 178 aa  227  8e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  220  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  220  8e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  220  8e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  220  8e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  59.2 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  59.2 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  59.2 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  59.2 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  59.2 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  59.09 
 
 		 177 aa  219  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  59.2 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  59.2 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  59.77 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  59.66 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0259  NusG antitermination factor  58.86 
 
 		 177 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  58.05 
 
 		 194 aa  217  5e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  58.76 
 
 		 177 aa  217  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  58.05 
 
 		 194 aa  217  6e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  56.5 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  57.47 
 
 		 194 aa  215  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  57.95 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  57.95 
 
 		 177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 177 aa  214  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  57.47 
 
 		 193 aa  214  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  57.47 
 
 		 193 aa  213  8e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 177 aa  213  9e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  54.55 
 
 		 177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  54.55 
 
 		 177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  56 
 
 		 188 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  54.29 
 
 		 192 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0742  NusG antitermination factor  56.5 
 
 		 179 aa  212  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  53.98 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  57.06 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1704  transcription antitermination protein nusG  57.14 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0348  NusG antitermination factor  57.14 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789152  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0334  NusG antitermination factor  57.14 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0344546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  56.82 
 
 		 177 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2547  NusG antitermination factor  57.14 
 
 		 178 aa  211  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 177 aa  211  4.9999999999999996e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  53.41 
 
 		 190 aa  209  1e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  55.11 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  59.43 
 
 		 178 aa  209  2e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0227  transcription antitermination protein nusG  54.86 
 
 		 177 aa  208  2e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  56.32 
 
 		 182 aa  209  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00690  transcription termination/antitermination factor NusG  56.65 
 
 		 183 aa  209  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000164845  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0560  transcription antitermination protein nusG  53.71 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  57.39 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 177 aa  208  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 177 aa  208  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  54.86 
 
 		 177 aa  207  5e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  55.38 
 
 		 187 aa  207  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  53.98 
 
 		 197 aa  207  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  53.41 
 
 		 202 aa  206  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  53.14 
 
 		 199 aa  206  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  56.5 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  56.5 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  55.17 
 
 		 182 aa  206  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0744  transcription antitermination protein NusG  55.49 
 
 		 186 aa  205  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000594191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  56.5 
 
 		 177 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  56.5 
 
 		 177 aa  206  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>