More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0121 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  100 
 
 		 188 aa  382  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  76.29 
 
 		 194 aa  305  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  83.14 
 
 		 194 aa  303  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  75.54 
 
 		 187 aa  293  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  62.86 
 
 		 201 aa  235  3e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  64.33 
 
 		 175 aa  231  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  63.69 
 
 		 177 aa  228  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  63.69 
 
 		 177 aa  228  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  63.1 
 
 		 177 aa  225  3e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  58.82 
 
 		 175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  63.1 
 
 		 175 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  58.62 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  55.56 
 
 		 175 aa  217  7.999999999999999e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  59.65 
 
 		 174 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  59.06 
 
 		 175 aa  208  4e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  58.48 
 
 		 181 aa  208  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  57.31 
 
 		 182 aa  204  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  57.31 
 
 		 182 aa  204  6e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  51.72 
 
 		 178 aa  203  1e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  53.8 
 
 		 203 aa  202  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  56.14 
 
 		 182 aa  201  5e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  57.47 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  56.47 
 
 		 176 aa  197  7.999999999999999e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  50.27 
 
 		 266 aa  195  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  54.6 
 
 		 172 aa  194  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  60 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  53.76 
 
 		 176 aa  192  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  59.41 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  59.41 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  59.41 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  59.41 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  59.41 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  59.41 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  59.41 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  59.41 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  59.41 
 
 		 177 aa  190  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  48.42 
 
 		 238 aa  189  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  51.61 
 
 		 177 aa  189  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  47.59 
 
 		 267 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  54.12 
 
 		 183 aa  188  2.9999999999999997e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  50.3 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  50.86 
 
 		 174 aa  187  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  50.55 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  48.91 
 
 		 306 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  47.18 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  53.71 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  46.84 
 
 		 272 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  46.6 
 
 		 270 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  46.6 
 
 		 270 aa  185  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  48.88 
 
 		 266 aa  185  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  50 
 
 		 180 aa  185  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  46.6 
 
 		 271 aa  184  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  49.15 
 
 		 202 aa  184  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  46.11 
 
 		 266 aa  184  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  49.41 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  46.11 
 
 		 193 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  47.85 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  47.09 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  46.11 
 
 		 193 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  47.09 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  47.85 
 
 		 185 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  44.62 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  47.09 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  47.09 
 
 		 185 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  53.45 
 
 		 178 aa  182  3e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  50 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 		 277 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  49.42 
 
 		 194 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  46.6 
 
 		 299 aa  181  5.0000000000000004e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  47.78 
 
 		 250 aa  181  6e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  48.02 
 
 		 185 aa  181  6e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  48.6 
 
 		 242 aa  181  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  46.56 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  46.56 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  46.56 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  46.56 
 
 		 185 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  48.04 
 
 		 242 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  50 
 
 		 243 aa  180  8.000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  46.03 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  46.03 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  48.57 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  46.03 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  46.03 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  46.03 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  46.03 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  46.03 
 
 		 185 aa  180  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  48.24 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  47.06 
 
 		 272 aa  179  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  48.6 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  47.46 
 
 		 183 aa  179  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  47.93 
 
 		 175 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  46.55 
 
 		 176 aa  178  4e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  47.19 
 
 		 198 aa  178  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  48.28 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  47.49 
 
 		 199 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  46.82 
 
 		 177 aa  177  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  46.86 
 
 		 192 aa  177  9e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  47.93 
 
 		 175 aa  177  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  46.24 
 
 		 176 aa  177  9e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  47.93 
 
 		 175 aa  177  9e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>