More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0835 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  100 
 
 		 176 aa  350  4e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  67.05 
 
 		 176 aa  259  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  64.77 
 
 		 176 aa  254  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  69.32 
 
 		 177 aa  250  6e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  61.36 
 
 		 176 aa  247  5e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  61.93 
 
 		 176 aa  244  4e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  61.36 
 
 		 176 aa  243  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  67.05 
 
 		 177 aa  243  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  61.36 
 
 		 176 aa  238  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  60.8 
 
 		 176 aa  237  6.999999999999999e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  64.77 
 
 		 177 aa  236  9e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  60.8 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  61.93 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  64.77 
 
 		 177 aa  236  1e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  63.84 
 
 		 177 aa  235  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  62.29 
 
 		 177 aa  235  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  59.09 
 
 		 176 aa  235  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  59.09 
 
 		 176 aa  234  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  64.2 
 
 		 177 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  64.2 
 
 		 177 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  62.5 
 
 		 177 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  59.43 
 
 		 185 aa  234  6e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  62.86 
 
 		 194 aa  233  8e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  60.23 
 
 		 176 aa  233  8e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  60.8 
 
 		 176 aa  233  9e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  60.23 
 
 		 176 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  60.23 
 
 		 176 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  57.95 
 
 		 176 aa  233  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  61.71 
 
 		 175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  62.71 
 
 		 177 aa  231  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  62.71 
 
 		 177 aa  231  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  63.28 
 
 		 177 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  63.28 
 
 		 177 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  63.28 
 
 		 177 aa  231  6e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  63.28 
 
 		 177 aa  230  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  59.09 
 
 		 177 aa  230  7.000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  59.66 
 
 		 176 aa  230  7.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  61.71 
 
 		 185 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  61.71 
 
 		 185 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  62.29 
 
 		 185 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  61.71 
 
 		 185 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  61.71 
 
 		 185 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  62.29 
 
 		 185 aa  230  8.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  62.5 
 
 		 177 aa  230  9e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  61.36 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  61.71 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  61.71 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  61.71 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  61.36 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  61.02 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  61.02 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  61.71 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  61.36 
 
 		 177 aa  229  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  62.29 
 
 		 185 aa  229  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  62.29 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  61.14 
 
 		 182 aa  228  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  61.71 
 
 		 193 aa  228  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  62.64 
 
 		 190 aa  228  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  59.2 
 
 		 185 aa  227  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  60.8 
 
 		 176 aa  228  5e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  63.64 
 
 		 177 aa  227  6e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  62.5 
 
 		 177 aa  227  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  58.76 
 
 		 177 aa  227  7e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  59.89 
 
 		 177 aa  227  7e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  58.76 
 
 		 177 aa  227  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  58.76 
 
 		 177 aa  227  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  60.57 
 
 		 185 aa  227  8e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  60.57 
 
 		 185 aa  227  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  61.36 
 
 		 177 aa  227  8e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  60.57 
 
 		 185 aa  227  8e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  60.57 
 
 		 185 aa  227  8e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  60.57 
 
 		 185 aa  227  8e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  60.57 
 
 		 185 aa  227  8e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  60.57 
 
 		 185 aa  227  8e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  63.01 
 
 		 190 aa  226  9e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  61.49 
 
 		 180 aa  226  9e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000173451  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  62.29 
 
 		 175 aa  226  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  61.36 
 
 		 177 aa  226  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  60.57 
 
 		 194 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  60.57 
 
 		 194 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  58.52 
 
 		 180 aa  225  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 		 181 aa  224  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  61.49 
 
 		 181 aa  224  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 		 181 aa  225  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 		 181 aa  224  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 		 181 aa  225  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 		 181 aa  224  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 		 181 aa  224  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 		 181 aa  225  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 		 181 aa  224  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 		 181 aa  225  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 		 181 aa  225  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 		 181 aa  224  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 		 181 aa  224  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  61.49 
 
 		 181 aa  224  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  59.43 
 
 		 182 aa  224  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  60.34 
 
 		 183 aa  224  4e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4329  NusG antitermination factor  60.92 
 
 		 183 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000065431  hitchhiker  0.00000000191931 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  62.16 
 
 		 187 aa  223  7e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 		 183 aa  223  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>