More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0973 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 		 176 aa  355  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  92.61 
 
 		 176 aa  335  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  91.48 
 
 		 176 aa  332  1e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  90.91 
 
 		 176 aa  330  6e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  84.39 
 
 		 174 aa  298  3e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  80.68 
 
 		 176 aa  297  4e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  81.82 
 
 		 175 aa  295  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  80.68 
 
 		 176 aa  295  2e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  81.82 
 
 		 175 aa  295  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  81.82 
 
 		 175 aa  295  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  79.55 
 
 		 176 aa  295  3e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  79.66 
 
 		 177 aa  293  8e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  79.55 
 
 		 177 aa  293  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  78.53 
 
 		 177 aa  292  2e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  78.98 
 
 		 176 aa  292  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  78.53 
 
 		 177 aa  292  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  79.66 
 
 		 177 aa  292  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  77.84 
 
 		 176 aa  292  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  78.53 
 
 		 177 aa  292  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  77.84 
 
 		 176 aa  291  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  77.27 
 
 		 176 aa  289  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  77.84 
 
 		 176 aa  289  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  76.14 
 
 		 176 aa  287  7e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  77.27 
 
 		 176 aa  286  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  75.57 
 
 		 176 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  75.14 
 
 		 185 aa  280  7.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  70.45 
 
 		 176 aa  268  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  73.99 
 
 		 185 aa  267  7e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  69.32 
 
 		 176 aa  265  2.9999999999999995e-70  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  65.34 
 
 		 177 aa  253  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  64.2 
 
 		 176 aa  250  7e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  61.36 
 
 		 176 aa  243  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  59.2 
 
 		 194 aa  225  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  58.05 
 
 		 194 aa  222  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  58.05 
 
 		 194 aa  222  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  58.52 
 
 		 177 aa  220  7e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 177 aa  216  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  57.95 
 
 		 177 aa  214  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  56.82 
 
 		 177 aa  214  4e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  57.39 
 
 		 178 aa  214  7e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  58.76 
 
 		 179 aa  214  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  57.47 
 
 		 193 aa  213  8e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  56.32 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  57.47 
 
 		 182 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  56.32 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  56.32 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  56.32 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  58.19 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  56.32 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  57.63 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  57.47 
 
 		 193 aa  213  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  56.32 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  56.32 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  56.32 
 
 		 185 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  55.75 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  56.32 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  55.75 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  56.32 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  55.75 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  55.75 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  55.75 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  55.75 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  55.75 
 
 		 185 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  56.32 
 
 		 185 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  57.95 
 
 		 177 aa  211  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0259  NusG antitermination factor  56.57 
 
 		 177 aa  211  3.9999999999999995e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 177 aa  211  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  56.07 
 
 		 190 aa  211  5.999999999999999e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  57.95 
 
 		 177 aa  210  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  57.95 
 
 		 177 aa  210  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  53.98 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  53.98 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  54.29 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  56.32 
 
 		 182 aa  209  1e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  53.98 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  57.63 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  55.17 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  51.7 
 
 		 176 aa  208  2e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  57.63 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  56.82 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  58.19 
 
 		 177 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  58.19 
 
 		 177 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  58.19 
 
 		 177 aa  208  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  55.75 
 
 		 182 aa  207  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  58.19 
 
 		 177 aa  207  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  56.25 
 
 		 178 aa  207  8e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0560  transcription antitermination protein nusG  54.86 
 
 		 177 aa  207  8e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  56.22 
 
 		 187 aa  207  9e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0227  transcription antitermination protein nusG  55.43 
 
 		 177 aa  207  9e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0348  NusG antitermination factor  56 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789152  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1704  transcription antitermination protein nusG  56 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0334  NusG antitermination factor  56 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0344546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2547  NusG antitermination factor  56 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0744  transcription antitermination protein NusG  54.4 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000594191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4288  NusG antitermination factor  56.25 
 
 		 177 aa  204  6e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000127222  hitchhiker  0.00000238714 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 177 aa  204  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  54.91 
 
 		 181 aa  203  9e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  50.57 
 
 		 180 aa  203  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>