More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4442 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  76.3 
 
 		 176 aa  283  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  71.74 
 
 		 185 aa  278  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  74.57 
 
 		 176 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  75.14 
 
 		 176 aa  276  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  74.57 
 
 		 176 aa  276  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  74.57 
 
 		 176 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  73.71 
 
 		 176 aa  275  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  73.99 
 
 		 176 aa  274  5e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  72.83 
 
 		 176 aa  272  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  72.57 
 
 		 176 aa  272  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  73.71 
 
 		 176 aa  271  4.0000000000000004e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  72.25 
 
 		 176 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  72.25 
 
 		 176 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  73.99 
 
 		 176 aa  267  8e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  73.41 
 
 		 176 aa  266  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  70.45 
 
 		 177 aa  263  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  70.45 
 
 		 177 aa  262  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  70.69 
 
 		 177 aa  262  2e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  68.75 
 
 		 177 aa  259  1e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  69.71 
 
 		 177 aa  259  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  68.75 
 
 		 177 aa  259  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  68.75 
 
 		 177 aa  259  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  71.68 
 
 		 175 aa  258  3e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  71.68 
 
 		 175 aa  258  3e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  65.9 
 
 		 176 aa  256  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  71.1 
 
 		 175 aa  255  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  66.47 
 
 		 176 aa  255  2e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  70.93 
 
 		 174 aa  251  4.0000000000000004e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0566  transcription antitermination protein NusG  64.16 
 
 		 176 aa  239  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268519  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  60.12 
 
 		 176 aa  236  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  59.43 
 
 		 176 aa  234  7e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  56.22 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  56.22 
 
 		 185 aa  226  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  55.14 
 
 		 185 aa  225  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  55.14 
 
 		 185 aa  225  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  55.14 
 
 		 185 aa  225  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  55.14 
 
 		 185 aa  225  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  56.22 
 
 		 185 aa  225  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  60.12 
 
 		 177 aa  225  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  59.43 
 
 		 177 aa  224  5.0000000000000005e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  55.14 
 
 		 185 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  55.14 
 
 		 185 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  55.14 
 
 		 185 aa  224  6e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  55.14 
 
 		 185 aa  224  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  55.14 
 
 		 185 aa  223  9e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  55.14 
 
 		 185 aa  223  9e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  55.14 
 
 		 185 aa  223  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  55.14 
 
 		 185 aa  223  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  55.14 
 
 		 185 aa  223  9e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  55.14 
 
 		 185 aa  223  9e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  55.14 
 
 		 185 aa  223  9e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  58.38 
 
 		 177 aa  223  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  59.54 
 
 		 177 aa  222  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  57.71 
 
 		 177 aa  221  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  56.22 
 
 		 193 aa  221  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  55.62 
 
 		 182 aa  220  8e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0227  transcription antitermination protein nusG  58.72 
 
 		 177 aa  219  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.355469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  56.04 
 
 		 193 aa  218  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  56.9 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  58.29 
 
 		 178 aa  218  3e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0259  NusG antitermination factor  56.9 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  56.76 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  56.9 
 
 		 194 aa  217  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  58.96 
 
 		 177 aa  217  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  54.49 
 
 		 182 aa  216  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 181 aa  216  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  56.25 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  58.05 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  58.05 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  57.8 
 
 		 177 aa  215  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  57.8 
 
 		 177 aa  215  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  56.25 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  58.05 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0593  NusG antitermination factor  55.14 
 
 		 190 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  57.47 
 
 		 177 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  53.93 
 
 		 182 aa  214  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  53.59 
 
 		 194 aa  214  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  56.9 
 
 		 177 aa  214  7e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 		 181 aa  214  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 		 181 aa  214  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 		 181 aa  214  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  53.59 
 
 		 194 aa  214  7e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  53.23 
 
 		 190 aa  214  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0334  NusG antitermination factor  57.56 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0344546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 		 181 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1704  transcription antitermination protein nusG  57.56 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  54.55 
 
 		 181 aa  213  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  51.85 
 
 		 190 aa  213  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 		 181 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  56.65 
 
 		 177 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  54.44 
 
 		 197 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>