More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A3183 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
185 aa  373  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
185 aa  373  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
185 aa  373  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
185 aa  373  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  99.46 
 
 
185 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  99.46 
 
 
185 aa  370  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  99.46 
 
 
185 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  99.46 
 
 
185 aa  370  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  97.84 
 
 
185 aa  367  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  97.84 
 
 
185 aa  367  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  97.84 
 
 
185 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  97.84 
 
 
185 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  97.84 
 
 
185 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  97.84 
 
 
185 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  97.84 
 
 
185 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  96.76 
 
 
185 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  96.76 
 
 
185 aa  365  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  96.76 
 
 
185 aa  364  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  90.81 
 
 
193 aa  339  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  89.19 
 
 
193 aa  338  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3039  transcription antitermination protein NusG  82.47 
 
 
194 aa  324  4.0000000000000003e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0831127 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3319  transcription antitermination protein NusG  84.78 
 
 
194 aa  320  7e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.243679  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  84.78 
 
 
194 aa  320  9.000000000000001e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65694 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  83.24 
 
 
190 aa  301  3.0000000000000004e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  81.03 
 
 
190 aa  298  3e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  77.66 
 
 
188 aa  295  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  79.89 
 
 
177 aa  292  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  78.16 
 
 
177 aa  292  2e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  76.76 
 
 
192 aa  290  7e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  78.33 
 
 
203 aa  284  5.999999999999999e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  73.54 
 
 
198 aa  282  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  75.86 
 
 
177 aa  282  2.0000000000000002e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  75 
 
 
199 aa  282  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  75.14 
 
 
197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  73.08 
 
 
196 aa  277  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  73.08 
 
 
196 aa  276  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  72.38 
 
 
202 aa  274  7e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  72.04 
 
 
194 aa  273  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  72.83 
 
 
177 aa  270  1e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  71.43 
 
 
177 aa  268  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2259  NusG antitermination factor  71.04 
 
 
212 aa  268  4e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.610472  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  69.73 
 
 
187 aa  264  5.999999999999999e-70  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  69.94 
 
 
177 aa  258  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  68.21 
 
 
177 aa  258  3e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  67.43 
 
 
177 aa  255  3e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  64.77 
 
 
177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  65.91 
 
 
177 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  65.71 
 
 
177 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  65.71 
 
 
177 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  65.34 
 
 
177 aa  248  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  65.91 
 
 
177 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0744  transcription antitermination protein NusG  65.57 
 
 
186 aa  249  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000594191  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  65.91 
 
 
177 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  65.91 
 
 
177 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  65.14 
 
 
177 aa  247  8e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4288  NusG antitermination factor  63.79 
 
 
177 aa  246  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000127222  hitchhiker  0.00000238714 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  65.52 
 
 
177 aa  246  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04536  transcription antitermination protein NusG  63.93 
 
 
185 aa  245  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  64.77 
 
 
177 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  64.77 
 
 
177 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  66.47 
 
 
177 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  66.47 
 
 
177 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  62.29 
 
 
177 aa  241  3e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3451  NusG antitermination factor  63.22 
 
 
183 aa  240  7.999999999999999e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0281776  normal  0.0124295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  62.64 
 
 
181 aa  239  2e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00690  transcription termination/antitermination factor NusG  63.79 
 
 
183 aa  239  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000164845  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  62.64 
 
 
181 aa  239  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  62.64 
 
 
181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  62.64 
 
 
181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  62.64 
 
 
181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  62.64 
 
 
181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  62.64 
 
 
181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  62.64 
 
 
181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  62.64 
 
 
181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  62.64 
 
 
181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  61.14 
 
 
182 aa  238  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  62.64 
 
 
181 aa  238  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  61.93 
 
 
176 aa  238  4e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  63.58 
 
 
177 aa  237  6.999999999999999e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  60.57 
 
 
182 aa  237  9e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  62.07 
 
 
181 aa  236  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  62.07 
 
 
181 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  62.07 
 
 
181 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  62.07 
 
 
181 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  62.07 
 
 
181 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  62.07 
 
 
181 aa  236  2e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  62.07 
 
 
181 aa  236  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 
181 aa  235  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 
181 aa  235  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  62.64 
 
 
176 aa  235  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 
181 aa  235  3e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00230  transcription antitermination protein NusG  60 
 
 
182 aa  234  4e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0272  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 
181 aa  234  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325159  normal  0.0243514 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2201  transcription antitermination protein NusG  60.66 
 
 
185 aa  234  6e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256386  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0192  transcription antitermination protein NusG  61.49 
 
 
181 aa  234  8e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000156554  normal  0.240176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0593  NusG antitermination factor  60.23 
 
 
190 aa  233  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000418183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2871  transcription antitermination protein NusG  60.92 
 
 
181 aa  233  9e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000236415  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  61.36 
 
 
179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2336  transcription antitermination protein NusG  64.57 
 
 
177 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000349971  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0497  transcription termination/antitermination factor NusG  60.23 
 
 
181 aa  232  2.0000000000000002e-60  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>