More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1544 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  100 
 
 		 180 aa  365  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  61.36 
 
 		 176 aa  240  7.999999999999999e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  60.57 
 
 		 177 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  60.67 
 
 		 179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  61.71 
 
 		 175 aa  229  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  62.29 
 
 		 175 aa  229  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  60.67 
 
 		 179 aa  229  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  61.71 
 
 		 175 aa  229  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  60.11 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  60.11 
 
 		 179 aa  227  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  61.14 
 
 		 175 aa  227  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  61.14 
 
 		 175 aa  227  7e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  59.65 
 
 		 184 aa  226  1e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  59.09 
 
 		 175 aa  225  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  60.8 
 
 		 177 aa  226  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  60.8 
 
 		 177 aa  225  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  57.89 
 
 		 180 aa  226  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  58.52 
 
 		 176 aa  225  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  60.23 
 
 		 179 aa  225  3e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  59.06 
 
 		 184 aa  223  9e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  59.06 
 
 		 183 aa  223  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  60.57 
 
 		 175 aa  222  2e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  58.52 
 
 		 177 aa  218  3e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  59.3 
 
 		 177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  59.3 
 
 		 177 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  57.95 
 
 		 177 aa  214  5e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 177 aa  212  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  53.41 
 
 		 176 aa  212  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  58.05 
 
 		 177 aa  211  4.9999999999999996e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  55.37 
 
 		 177 aa  211  4.9999999999999996e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  54.8 
 
 		 177 aa  210  7.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  55.37 
 
 		 177 aa  210  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  55.37 
 
 		 177 aa  210  9e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  55.37 
 
 		 177 aa  210  9e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  55.37 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  53.41 
 
 		 176 aa  210  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  54.24 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  54.24 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  56.82 
 
 		 177 aa  209  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  56.98 
 
 		 190 aa  209  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  55.11 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  55.11 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  56.25 
 
 		 185 aa  208  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 		 185 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2725  transcription antitermination protein NusG  54.86 
 
 		 182 aa  207  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 		 185 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  55.11 
 
 		 177 aa  207  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 		 185 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 		 185 aa  207  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 		 185 aa  207  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 		 185 aa  207  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 		 185 aa  207  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  55.68 
 
 		 185 aa  207  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  55.11 
 
 		 177 aa  207  8e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  53.98 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  54.89 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  53.98 
 
 		 177 aa  205  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  51.7 
 
 		 176 aa  204  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  54.65 
 
 		 199 aa  204  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  56.14 
 
 		 189 aa  204  6e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 		 183 aa  204  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002168  transcription antitermination protein NusG  53.14 
 
 		 182 aa  204  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000118825  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  54.65 
 
 		 198 aa  204  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 		 181 aa  203  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  54.6 
 
 		 181 aa  203  9e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 		 181 aa  203  9e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 		 181 aa  203  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 		 181 aa  203  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 		 181 aa  203  9e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 		 181 aa  203  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 		 181 aa  203  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  54.6 
 
 		 181 aa  203  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  55.75 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  55.75 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  51.14 
 
 		 176 aa  203  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  55.75 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  53.98 
 
 		 177 aa  203  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  54.34 
 
 		 188 aa  203  1e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  51.16 
 
 		 176 aa  202  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 		 181 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  55.81 
 
 		 202 aa  202  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 		 181 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 		 181 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  54.6 
 
 		 181 aa  203  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0184  NusG antitermination factor  55.75 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000410017  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4068  NusG antitermination factor  55.75 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000120393  hitchhiker  0.00918489 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  50.57 
 
 		 176 aa  203  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  54.34 
 
 		 192 aa  202  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  55.75 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000177465  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  55.75 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000371558  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  55.75 
 
 		 183 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>