More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2719 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  100 
 
 		 177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  90.64 
 
 		 172 aa  316  9e-86  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  70 
 
 		 174 aa  250  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  65.5 
 
 		 173 aa  237  8e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  65.5 
 
 		 173 aa  237  8e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  65.32 
 
 		 174 aa  223  1e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  64.12 
 
 		 175 aa  222  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  63.01 
 
 		 175 aa  221  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  61.08 
 
 		 172 aa  218  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  61.49 
 
 		 175 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  55.25 
 
 		 203 aa  207  6e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  63.74 
 
 		 175 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  63.58 
 
 		 175 aa  205  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  57.23 
 
 		 174 aa  203  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  58.05 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  59.77 
 
 		 176 aa  198  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  55.11 
 
 		 181 aa  198  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  57.95 
 
 		 177 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  57.47 
 
 		 182 aa  194  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  57.47 
 
 		 182 aa  194  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  57.47 
 
 		 182 aa  191  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  51.61 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  52.57 
 
 		 194 aa  189  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  50.54 
 
 		 194 aa  187  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  60.8 
 
 		 177 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  50 
 
 		 187 aa  185  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  58.52 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  58.52 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  58.52 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  58.52 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  58.52 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  58.52 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  58.52 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  58.52 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  58.52 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  57.95 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1148  NusG antitermination factor  48.26 
 
 		 207 aa  177  4.999999999999999e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000795097  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  48.57 
 
 		 180 aa  176  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  45.79 
 
 		 272 aa  175  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  52.05 
 
 		 201 aa  174  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  49.13 
 
 		 175 aa  174  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  48.88 
 
 		 181 aa  174  6e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  49.42 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  47.7 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  48.09 
 
 		 266 aa  171  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  45.13 
 
 		 265 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  50.58 
 
 		 175 aa  171  5e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  54.29 
 
 		 178 aa  171  5e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  46.91 
 
 		 276 aa  171  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  48.26 
 
 		 177 aa  171  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  46.77 
 
 		 273 aa  170  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  46.37 
 
 		 188 aa  169  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  52 
 
 		 178 aa  169  1e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  50.85 
 
 		 181 aa  169  1e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  46.33 
 
 		 243 aa  169  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  50 
 
 		 183 aa  170  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  45.45 
 
 		 267 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  43.72 
 
 		 266 aa  168  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  45.79 
 
 		 272 aa  168  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  46.55 
 
 		 184 aa  167  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  50.28 
 
 		 185 aa  168  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  44.85 
 
 		 266 aa  168  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  45.99 
 
 		 273 aa  167  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  44.51 
 
 		 183 aa  167  7e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  44.5 
 
 		 270 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  44.5 
 
 		 270 aa  167  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  45.3 
 
 		 238 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  47.7 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  45.3 
 
 		 250 aa  166  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  44.5 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  46.24 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  49.42 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  46.51 
 
 		 175 aa  165  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  46.51 
 
 		 175 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  45.09 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  45.4 
 
 		 192 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  45.25 
 
 		 277 aa  165  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  47.13 
 
 		 177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  47.7 
 
 		 177 aa  164  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  45.03 
 
 		 299 aa  165  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  46.82 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  48.84 
 
 		 175 aa  164  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  46.49 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  46.49 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  46.49 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  46.49 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  46.49 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  46.49 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  46.49 
 
 		 185 aa  164  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  52.02 
 
 		 176 aa  164  6.9999999999999995e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  45.66 
 
 		 176 aa  164  9e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  46.49 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  46.49 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  46.49 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  44.1 
 
 		 238 aa  163  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  46.49 
 
 		 185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  46.51 
 
 		 180 aa  163  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  41.53 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  46.49 
 
 		 185 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  46.49 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>