More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2130 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  100 
 
 		 176 aa  356  9.999999999999999e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  81.46 
 
 		 178 aa  297  5e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  80.9 
 
 		 178 aa  297  7e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  66.67 
 
 		 181 aa  254  4e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  58.52 
 
 		 174 aa  208  3e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  56.52 
 
 		 266 aa  208  3e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  55.61 
 
 		 306 aa  206  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  53.19 
 
 		 267 aa  202  3e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  52.78 
 
 		 266 aa  201  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  53.45 
 
 		 194 aa  197  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  53.67 
 
 		 243 aa  197  7e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  53.45 
 
 		 194 aa  196  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  54.91 
 
 		 201 aa  195  2.0000000000000003e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  53.63 
 
 		 273 aa  194  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  53.59 
 
 		 238 aa  193  8.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  53.45 
 
 		 175 aa  193  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  51.89 
 
 		 246 aa  192  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  52.72 
 
 		 250 aa  192  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  53.76 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  53.41 
 
 		 277 aa  192  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  53.18 
 
 		 173 aa  191  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  50.54 
 
 		 280 aa  190  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  50.79 
 
 		 272 aa  190  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  51.72 
 
 		 187 aa  189  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  52.84 
 
 		 175 aa  188  4e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  49.48 
 
 		 272 aa  188  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  50.57 
 
 		 175 aa  188  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  49.74 
 
 		 270 aa  187  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  49.74 
 
 		 270 aa  187  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  49.74 
 
 		 271 aa  186  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  49.42 
 
 		 203 aa  186  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  50.27 
 
 		 265 aa  186  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  48.97 
 
 		 266 aa  186  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  56.25 
 
 		 175 aa  184  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  48.72 
 
 		 276 aa  184  7e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  50.79 
 
 		 238 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  53.33 
 
 		 228 aa  182  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  52.84 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  49.48 
 
 		 299 aa  180  8.000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  50 
 
 		 177 aa  180  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 177 aa  179  1e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  51.11 
 
 		 181 aa  179  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  50.28 
 
 		 178 aa  179  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  51.67 
 
 		 242 aa  180  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  49.43 
 
 		 177 aa  179  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  51.11 
 
 		 242 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  50.55 
 
 		 273 aa  178  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  47.85 
 
 		 273 aa  178  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  50.81 
 
 		 185 aa  177  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  53.98 
 
 		 175 aa  177  9e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  49.19 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  50.28 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  51.14 
 
 		 175 aa  174  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  50.29 
 
 		 199 aa  174  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  52.84 
 
 		 175 aa  173  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  50.28 
 
 		 177 aa  173  9e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  52.27 
 
 		 175 aa  173  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  52.84 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  52.84 
 
 		 175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  50.56 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  47.03 
 
 		 301 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  50 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  51.14 
 
 		 175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  50 
 
 		 182 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  48.09 
 
 		 287 aa  171  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  48.59 
 
 		 177 aa  170  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  49.44 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  50.87 
 
 		 174 aa  169  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  47.19 
 
 		 176 aa  169  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  51.67 
 
 		 262 aa  168  4e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  46.74 
 
 		 267 aa  168  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  45.51 
 
 		 176 aa  167  6e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  50.84 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  47.75 
 
 		 176 aa  166  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  48.02 
 
 		 175 aa  165  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  47.19 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17300  transcription termination/antitermination factor NusG  45.88 
 
 		 275 aa  166  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  48.3 
 
 		 180 aa  166  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  45.51 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  51.72 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  45.51 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  46.33 
 
 		 177 aa  164  5e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  46.07 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  46.07 
 
 		 176 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  46.07 
 
 		 177 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  45.88 
 
 		 269 aa  164  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  48.3 
 
 		 181 aa  164  6.9999999999999995e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  52.02 
 
 		 177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  44.94 
 
 		 176 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  45.51 
 
 		 176 aa  164  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  43.26 
 
 		 176 aa  163  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  47.75 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  45.31 
 
 		 296 aa  163  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  44.89 
 
 		 185 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  44.32 
 
 		 178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  48.6 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  45.76 
 
 		 183 aa  162  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>