More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2707 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  100 
 
 		 267 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  81.94 
 
 		 287 aa  417  1e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17300  transcription termination/antitermination factor NusG  60.64 
 
 		 275 aa  307  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  63.84 
 
 		 265 aa  305  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  58.93 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  64.85 
 
 		 273 aa  289  4e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0675  NusG antitermination factor  60.29 
 
 		 320 aa  280  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2677  NusG antitermination factor  66.81 
 
 		 255 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  62.34 
 
 		 296 aa  276  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  60.83 
 
 		 266 aa  268  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  63.05 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  55.22 
 
 		 266 aa  265  8e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  55.56 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  58.26 
 
 		 238 aa  262  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3162  NusG antitermination factor  68.56 
 
 		 259 aa  256  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.204879 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  60.4 
 
 		 301 aa  256  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  54.12 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  59.53 
 
 		 276 aa  252  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  55.65 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  49.82 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  55.65 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  57.26 
 
 		 238 aa  248  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  60.4 
 
 		 306 aa  246  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  59.31 
 
 		 250 aa  246  3e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  59.42 
 
 		 271 aa  242  5e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  54.92 
 
 		 266 aa  241  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  51.53 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  59.9 
 
 		 299 aa  240  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  57.08 
 
 		 228 aa  232  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  58.29 
 
 		 273 aa  231  8.000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  57.02 
 
 		 262 aa  230  2e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  58.42 
 
 		 242 aa  229  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  54.33 
 
 		 317 aa  229  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  53.31 
 
 		 246 aa  228  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  53.45 
 
 		 242 aa  227  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  51.92 
 
 		 269 aa  204  9e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1217  transcription termination/antitermination factor NusG  47.73 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1622  transcription antiterminator  41.15 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000761547  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  40.23 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  50.27 
 
 		 175 aa  181  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  48.37 
 
 		 175 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  47.83 
 
 		 178 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  39.53 
 
 		 203 aa  171  1e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  49.46 
 
 		 181 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  46.52 
 
 		 175 aa  169  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  46.74 
 
 		 176 aa  168  8e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  47.54 
 
 		 187 aa  166  5e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  44.27 
 
 		 194 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  44.27 
 
 		 194 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  45.26 
 
 		 177 aa  161  9e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  43.72 
 
 		 176 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  45.9 
 
 		 188 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  43.48 
 
 		 181 aa  159  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  44.02 
 
 		 178 aa  158  9e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  45.45 
 
 		 172 aa  158  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  47.54 
 
 		 175 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  43.55 
 
 		 174 aa  156  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  44.39 
 
 		 177 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  44.74 
 
 		 185 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  44.81 
 
 		 175 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  45.79 
 
 		 177 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  44.81 
 
 		 173 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  44.81 
 
 		 173 aa  153  4e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  44.39 
 
 		 177 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  43.85 
 
 		 177 aa  150  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  44.39 
 
 		 176 aa  151  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  43.72 
 
 		 201 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  45.36 
 
 		 173 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  44.21 
 
 		 185 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  41.4 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  41.4 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  41.94 
 
 		 178 aa  150  3e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  45.26 
 
 		 177 aa  149  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  45.26 
 
 		 177 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  45.26 
 
 		 177 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  45.26 
 
 		 177 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  45.26 
 
 		 177 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  45.26 
 
 		 177 aa  149  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  45.26 
 
 		 177 aa  149  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  45.26 
 
 		 177 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  43.85 
 
 		 177 aa  149  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  45.26 
 
 		 177 aa  149  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  43.96 
 
 		 177 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  44.74 
 
 		 177 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  40.32 
 
 		 182 aa  146  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  43.96 
 
 		 175 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  43.86 
 
 		 181 aa  147  3e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  43.96 
 
 		 175 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  42.02 
 
 		 174 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  39.89 
 
 		 199 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  43.01 
 
 		 177 aa  142  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  43.48 
 
 		 185 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  43.48 
 
 		 185 aa  142  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  43.48 
 
 		 185 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  43.48 
 
 		 185 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  43.48 
 
 		 185 aa  142  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  43.48 
 
 		 185 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  43.48 
 
 		 185 aa  142  5e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  41.63 
 
 		 193 aa  142  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  46.74 
 
 		 190 aa  142  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>