More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0537 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  100 
 
 
246 aa  490  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  76.19 
 
 
266 aa  325  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  67.78 
 
 
238 aa  314  8e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  76.02 
 
 
250 aa  296  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  71.64 
 
 
280 aa  292  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  61.23 
 
 
266 aa  277  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  62.67 
 
 
267 aa  275  6e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  58.94 
 
 
273 aa  271  7e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  64.16 
 
 
228 aa  266  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  63.68 
 
 
272 aa  262  4e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  55 
 
 
272 aa  261  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  61.43 
 
 
276 aa  259  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  57.21 
 
 
242 aa  259  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  63.5 
 
 
273 aa  258  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  58.82 
 
 
238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  57.26 
 
 
242 aa  257  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  63 
 
 
306 aa  257  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  58.4 
 
 
270 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  58.4 
 
 
270 aa  256  2e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  54.26 
 
 
273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  60.47 
 
 
266 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2677  NusG antitermination factor  60.59 
 
 
255 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  67.01 
 
 
265 aa  251  6e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  53.44 
 
 
271 aa  251  6e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  54.94 
 
 
296 aa  250  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  62.3 
 
 
277 aa  249  2e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  59.62 
 
 
269 aa  246  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0675  NusG antitermination factor  60.87 
 
 
320 aa  246  2e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814354  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  59.41 
 
 
299 aa  244  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  61.42 
 
 
262 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  53.02 
 
 
301 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  60.61 
 
 
287 aa  241  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17300  transcription termination/antitermination factor NusG  54.47 
 
 
275 aa  238  5e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  59.69 
 
 
267 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3162  NusG antitermination factor  65.28 
 
 
259 aa  231  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.204879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  54.11 
 
 
317 aa  229  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  53.85 
 
 
176 aa  197  9e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  45.3 
 
 
243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  50.81 
 
 
178 aa  194  9e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  51.35 
 
 
178 aa  193  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1622  transcription antiterminator  51.21 
 
 
297 aa  193  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000761547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  50 
 
 
181 aa  189  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  49.45 
 
 
175 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1217  transcription termination/antitermination factor NusG  50.51 
 
 
298 aa  187  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  48.89 
 
 
175 aa  185  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  48.07 
 
 
176 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  47.51 
 
 
188 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  48.62 
 
 
173 aa  179  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  46.67 
 
 
187 aa  178  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  51.06 
 
 
185 aa  178  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  47.57 
 
 
181 aa  177  9e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  46.41 
 
 
174 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  46.99 
 
 
177 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  49.46 
 
 
175 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  39.44 
 
 
203 aa  175  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  46.03 
 
 
194 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  45.99 
 
 
194 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  47.78 
 
 
177 aa  171  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  49.73 
 
 
185 aa  171  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  47.22 
 
 
177 aa  171  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  45.95 
 
 
183 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  47.78 
 
 
177 aa  170  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  46.99 
 
 
174 aa  170  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  50.28 
 
 
175 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  46.45 
 
 
182 aa  168  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  46.45 
 
 
182 aa  168  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  45.9 
 
 
182 aa  168  7e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  45 
 
 
180 aa  165  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  45.86 
 
 
201 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  46.7 
 
 
176 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  47.51 
 
 
175 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  46.11 
 
 
177 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  42.25 
 
 
178 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  45.86 
 
 
172 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  45.3 
 
 
177 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  46.99 
 
 
177 aa  162  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  46.45 
 
 
177 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  46.99 
 
 
177 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  44.74 
 
 
189 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  46.11 
 
 
175 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  46.11 
 
 
175 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  42.78 
 
 
185 aa  159  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  46.45 
 
 
177 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  46.45 
 
 
177 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  46.45 
 
 
177 aa  159  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  46.45 
 
 
177 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  46.45 
 
 
177 aa  159  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  46.45 
 
 
177 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  46.45 
 
 
177 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  42.78 
 
 
176 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  46.45 
 
 
177 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  39.44 
 
 
199 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  41.67 
 
 
178 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  43.33 
 
 
176 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  43.89 
 
 
176 aa  156  3e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  43.33 
 
 
176 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  44.2 
 
 
175 aa  156  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  45.86 
 
 
185 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  43.89 
 
 
176 aa  156  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  45.86 
 
 
185 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>