More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03630 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  100 
 
 		 267 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  65.59 
 
 		 266 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  64.1 
 
 		 272 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  69.14 
 
 		 270 aa  309  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  69.14 
 
 		 270 aa  309  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  72.05 
 
 		 238 aa  306  3e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  75 
 
 		 266 aa  306  3e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  75.24 
 
 		 271 aa  304  9.000000000000001e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  63.46 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  71.5 
 
 		 306 aa  298  9e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  65.2 
 
 		 273 aa  295  7e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  62.4 
 
 		 266 aa  295  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  61.3 
 
 		 272 aa  294  9e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  66.24 
 
 		 238 aa  293  2e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  62.71 
 
 		 242 aa  288  9e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  70.79 
 
 		 299 aa  286  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  63.14 
 
 		 242 aa  285  7e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  68.14 
 
 		 250 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  57.41 
 
 		 280 aa  277  1e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  68.69 
 
 		 273 aa  274  9e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  56.15 
 
 		 273 aa  273  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  67.44 
 
 		 228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  67.17 
 
 		 277 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2677  NusG antitermination factor  63.25 
 
 		 255 aa  271  8.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  68.18 
 
 		 265 aa  270  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  64.04 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  57.14 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  63.32 
 
 		 267 aa  261  8e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  56.09 
 
 		 301 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  59.56 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  62.98 
 
 		 269 aa  259  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17300  transcription termination/antitermination factor NusG  55.94 
 
 		 275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0675  NusG antitermination factor  56.73 
 
 		 320 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3162  NusG antitermination factor  55.85 
 
 		 259 aa  244  8e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.204879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  58.94 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  60.5 
 
 		 262 aa  232  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  45.45 
 
 		 243 aa  211  1e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  53.19 
 
 		 176 aa  202  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1217  transcription termination/antitermination factor NusG  50.25 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1622  transcription antiterminator  49.52 
 
 		 297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000761547  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  50.25 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  50.79 
 
 		 178 aa  191  8e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  47.59 
 
 		 188 aa  191  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  49.47 
 
 		 178 aa  190  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  48.66 
 
 		 176 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  47.59 
 
 		 194 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  47.59 
 
 		 194 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  47.87 
 
 		 177 aa  185  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  48.69 
 
 		 177 aa  185  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  48.94 
 
 		 175 aa  185  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  49.21 
 
 		 175 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  47.34 
 
 		 177 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  47.34 
 
 		 177 aa  182  7e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  45.45 
 
 		 187 aa  180  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  45.99 
 
 		 175 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  46.28 
 
 		 181 aa  180  2.9999999999999997e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  47.94 
 
 		 185 aa  176  3e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  47.06 
 
 		 201 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  47.09 
 
 		 174 aa  175  6e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  45.99 
 
 		 173 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  41.84 
 
 		 203 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  47.94 
 
 		 185 aa  172  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  48.39 
 
 		 177 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  47.59 
 
 		 172 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  45.45 
 
 		 177 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  44.21 
 
 		 183 aa  169  5e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  47.12 
 
 		 177 aa  168  8e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  45.26 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  45.26 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  42.11 
 
 		 178 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  47.37 
 
 		 177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  43.81 
 
 		 180 aa  165  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  44.92 
 
 		 174 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  47.37 
 
 		 177 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  47.37 
 
 		 177 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  47.37 
 
 		 177 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  47.37 
 
 		 177 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  47.37 
 
 		 177 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  47.37 
 
 		 177 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  47.37 
 
 		 177 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  47.37 
 
 		 177 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  44.74 
 
 		 182 aa  165  8e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  46.52 
 
 		 176 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  47.37 
 
 		 177 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  48.13 
 
 		 175 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  46.56 
 
 		 175 aa  161  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  46.52 
 
 		 180 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  42.25 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  42.78 
 
 		 173 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  42.78 
 
 		 173 aa  159  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  43.3 
 
 		 188 aa  159  5e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  41.58 
 
 		 176 aa  159  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0832  transcription antitermination protein nusG  41.71 
 
 		 178 aa  158  9e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  39.04 
 
 		 178 aa  158  9e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  43.32 
 
 		 176 aa  158  9e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  42.78 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  43 
 
 		 193 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  43 
 
 		 193 aa  158  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2562  transcription antitermination protein nusG  42.25 
 
 		 179 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0500837 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  46.19 
 
 		 190 aa  157  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>