More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2659 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 		 250 aa  499  1e-140  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  68.57 
 
 		 280 aa  359  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  74.3 
 
 		 266 aa  325  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  78.28 
 
 		 238 aa  323  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  65.22 
 
 		 246 aa  290  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  68.14 
 
 		 267 aa  289  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  61.92 
 
 		 272 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  63.89 
 
 		 266 aa  283  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  61.57 
 
 		 238 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  58.3 
 
 		 273 aa  281  5.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  61.54 
 
 		 242 aa  273  1.0000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  56.22 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  62.38 
 
 		 276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  71.43 
 
 		 228 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  56.65 
 
 		 266 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  61.09 
 
 		 242 aa  271  6e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  61.04 
 
 		 270 aa  271  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  61.04 
 
 		 270 aa  271  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  64.25 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  64.32 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2677  NusG antitermination factor  61.57 
 
 		 255 aa  265  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  68.25 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  64.47 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  64.5 
 
 		 265 aa  260  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  69.78 
 
 		 277 aa  259  3e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  60.66 
 
 		 269 aa  258  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  62.19 
 
 		 287 aa  255  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  61.88 
 
 		 299 aa  255  5e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0675  NusG antitermination factor  61.23 
 
 		 320 aa  254  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  61.11 
 
 		 267 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3162  NusG antitermination factor  65.31 
 
 		 259 aa  245  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.204879 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  55.41 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  56.04 
 
 		 317 aa  240  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17300  transcription termination/antitermination factor NusG  49.45 
 
 		 275 aa  239  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  53.85 
 
 		 301 aa  239  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  61.66 
 
 		 262 aa  231  7.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  46.47 
 
 		 243 aa  208  8e-53  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1622  transcription antiterminator  52.53 
 
 		 297 aa  201  9.999999999999999e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000761547  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1217  transcription termination/antitermination factor NusG  52.53 
 
 		 298 aa  201  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  53.59 
 
 		 176 aa  200  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  53.07 
 
 		 175 aa  199  3.9999999999999996e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  52.51 
 
 		 175 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  52.51 
 
 		 175 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  54.19 
 
 		 173 aa  188  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  50.56 
 
 		 174 aa  188  7e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  51.37 
 
 		 181 aa  188  7e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  53.76 
 
 		 185 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  50 
 
 		 187 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  49.46 
 
 		 178 aa  186  2e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  49.73 
 
 		 181 aa  186  4e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  47.78 
 
 		 176 aa  185  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  48.89 
 
 		 188 aa  184  9e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  50.54 
 
 		 177 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  46.81 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  46.81 
 
 		 194 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  49.72 
 
 		 178 aa  183  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  48.33 
 
 		 201 aa  181  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  50 
 
 		 175 aa  181  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  45.21 
 
 		 203 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  48.89 
 
 		 175 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  47.78 
 
 		 183 aa  176  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  49.72 
 
 		 177 aa  175  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  52.15 
 
 		 185 aa  175  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 177 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  49.16 
 
 		 177 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  46.45 
 
 		 178 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  49.72 
 
 		 180 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  48.6 
 
 		 189 aa  171  7.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  48.6 
 
 		 177 aa  171  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  48.33 
 
 		 172 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  46.15 
 
 		 180 aa  169  4e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  47.22 
 
 		 176 aa  169  4e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  46.96 
 
 		 174 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  47.49 
 
 		 175 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  47.49 
 
 		 175 aa  169  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  46.37 
 
 		 181 aa  168  7e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  48.35 
 
 		 182 aa  167  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  45.86 
 
 		 177 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  49.46 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  48.9 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  48.9 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  46.37 
 
 		 175 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  46.11 
 
 		 175 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  51.32 
 
 		 190 aa  165  5.9999999999999996e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  44.69 
 
 		 185 aa  164  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  46.93 
 
 		 175 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  44.44 
 
 		 199 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  45.81 
 
 		 175 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  45.81 
 
 		 175 aa  162  7e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  46.67 
 
 		 177 aa  161  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  43.58 
 
 		 176 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  44.69 
 
 		 173 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  44.69 
 
 		 173 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  43.58 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  43.58 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  44.69 
 
 		 180 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  45 
 
 		 176 aa  159  5e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  43.89 
 
 		 176 aa  159  5e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  43.58 
 
 		 176 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  43.02 
 
 		 176 aa  158  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>