More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0695 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  100 
 
 		 317 aa  636    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  64.29 
 
 		 273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  64.36 
 
 		 265 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  53.33 
 
 		 273 aa  261  1e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  59.91 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0675  NusG antitermination factor  49.23 
 
 		 320 aa  253  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2677  NusG antitermination factor  61.5 
 
 		 255 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  46.98 
 
 		 266 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  54.24 
 
 		 266 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  57 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  61.06 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  58.45 
 
 		 272 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17300  transcription termination/antitermination factor NusG  52.38 
 
 		 275 aa  242  7e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3162  NusG antitermination factor  63.41 
 
 		 259 aa  241  1e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.204879 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  54.59 
 
 		 250 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  57.89 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  54.11 
 
 		 238 aa  240  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  52.46 
 
 		 270 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  52.46 
 
 		 270 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  55.56 
 
 		 280 aa  236  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  56.52 
 
 		 287 aa  235  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  55.56 
 
 		 271 aa  235  9e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  57.48 
 
 		 262 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  54.55 
 
 		 238 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  50.37 
 
 		 276 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  51.04 
 
 		 246 aa  233  3e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  51.33 
 
 		 301 aa  232  6e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  52.99 
 
 		 296 aa  232  7.000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  56.86 
 
 		 267 aa  231  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  56.28 
 
 		 266 aa  231  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  54.46 
 
 		 277 aa  228  8e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  49.04 
 
 		 242 aa  228  8e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  48.28 
 
 		 242 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  53.33 
 
 		 273 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  56.44 
 
 		 299 aa  226  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  56.19 
 
 		 269 aa  223  3e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  43.88 
 
 		 243 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  47.69 
 
 		 181 aa  179  5.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  45.03 
 
 		 175 aa  178  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1622  transcription antiterminator  43.98 
 
 		 297 aa  176  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000761547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  45.03 
 
 		 173 aa  175  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1217  transcription termination/antitermination factor NusG  44.65 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  45.03 
 
 		 187 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  43.75 
 
 		 175 aa  172  5e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  45.03 
 
 		 194 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  45.5 
 
 		 185 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  44.9 
 
 		 177 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  44.5 
 
 		 194 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  45.31 
 
 		 178 aa  168  9e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  44.39 
 
 		 177 aa  168  9e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  43.46 
 
 		 175 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 		 174 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  44.39 
 
 		 177 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  39.38 
 
 		 203 aa  166  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  44.04 
 
 		 178 aa  167  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  43.59 
 
 		 177 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  45.03 
 
 		 188 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  45.55 
 
 		 172 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  45.5 
 
 		 185 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  44.56 
 
 		 176 aa  162  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  43.46 
 
 		 176 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  45.03 
 
 		 177 aa  162  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  41.67 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  42.93 
 
 		 180 aa  160  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  41.67 
 
 		 181 aa  159  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  42.93 
 
 		 174 aa  159  6e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  45.36 
 
 		 180 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  43.46 
 
 		 203 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  45.55 
 
 		 176 aa  155  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  42.93 
 
 		 177 aa  155  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  41.24 
 
 		 178 aa  154  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 185 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  40.31 
 
 		 177 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 185 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 185 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  37.7 
 
 		 199 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 185 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 185 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 185 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 185 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  43.98 
 
 		 175 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  42.05 
 
 		 198 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 185 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 185 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 185 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 185 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  40.84 
 
 		 176 aa  152  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  43.46 
 
 		 175 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 185 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 185 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 185 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  41.67 
 
 		 185 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  44.62 
 
 		 177 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  41.54 
 
 		 199 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  41.15 
 
 		 185 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  41.15 
 
 		 185 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  41.88 
 
 		 173 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  41.88 
 
 		 173 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  41.15 
 
 		 185 aa  151  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  41.36 
 
 		 197 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>