More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0575 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  100 
 
 		 273 aa  555  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  65.61 
 
 		 273 aa  349  3e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  72.22 
 
 		 265 aa  313  9.999999999999999e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2677  NusG antitermination factor  72.27 
 
 		 255 aa  295  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2995  NusG antitermination factor  71.21 
 
 		 287 aa  291  7e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3162  NusG antitermination factor  76.53 
 
 		 259 aa  290  1e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.204879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0675  NusG antitermination factor  73.53 
 
 		 320 aa  288  7e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0814354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2707  NusG antitermination factor  71.94 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  64.19 
 
 		 301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  63.72 
 
 		 267 aa  281  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  56.41 
 
 		 266 aa  279  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21030  transcription antitermination protein nusG  63.3 
 
 		 296 aa  276  2e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0843287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  66.67 
 
 		 238 aa  271  7e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  58.24 
 
 		 272 aa  271  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  61.99 
 
 		 266 aa  270  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17300  transcription termination/antitermination factor NusG  56.72 
 
 		 275 aa  268  5.9999999999999995e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  64.29 
 
 		 306 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  60.81 
 
 		 272 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  53.65 
 
 		 276 aa  262  6e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  62.28 
 
 		 228 aa  261  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  66.84 
 
 		 277 aa  261  8e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  63.51 
 
 		 250 aa  261  8.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  64.36 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0695  transcription termination/antitermination factor NusG  61.54 
 
 		 317 aa  257  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  59.91 
 
 		 270 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  59.91 
 
 		 270 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  54.58 
 
 		 271 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  55.25 
 
 		 246 aa  249  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  60.2 
 
 		 280 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  54.47 
 
 		 238 aa  249  4e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  61.43 
 
 		 266 aa  248  6e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  59.15 
 
 		 242 aa  247  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  58.69 
 
 		 242 aa  244  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  60.4 
 
 		 299 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  62.75 
 
 		 262 aa  240  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  58.85 
 
 		 269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1622  transcription antiterminator  45.8 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000761547  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1217  transcription termination/antitermination factor NusG  53.81 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000707521 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  40.46 
 
 		 243 aa  199  5e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  52.2 
 
 		 175 aa  193  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  52.49 
 
 		 175 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  53.3 
 
 		 175 aa  190  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  51.31 
 
 		 181 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  50.82 
 
 		 176 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  46.77 
 
 		 178 aa  182  6e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  48.35 
 
 		 176 aa  180  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  48.09 
 
 		 178 aa  179  4e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  52.46 
 
 		 175 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  48.9 
 
 		 187 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  48.35 
 
 		 173 aa  175  6e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  49.47 
 
 		 185 aa  175  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  47.8 
 
 		 194 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  47.8 
 
 		 194 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  49.18 
 
 		 175 aa  171  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  47.25 
 
 		 188 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  43.24 
 
 		 203 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  49.47 
 
 		 185 aa  169  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  44.32 
 
 		 178 aa  169  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  46.7 
 
 		 173 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  46.7 
 
 		 173 aa  169  7e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  45.99 
 
 		 177 aa  168  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  47.25 
 
 		 172 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  46.99 
 
 		 174 aa  166  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  47.51 
 
 		 177 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  47.51 
 
 		 177 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  44.26 
 
 		 181 aa  165  9e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  46.15 
 
 		 201 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  46.96 
 
 		 177 aa  163  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  44.57 
 
 		 177 aa  162  7e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  47.54 
 
 		 174 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  46.7 
 
 		 203 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  45.65 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  42.55 
 
 		 180 aa  157  1e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  46.15 
 
 		 176 aa  157  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  45.11 
 
 		 177 aa  156  3e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  45.11 
 
 		 177 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  45.11 
 
 		 177 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  45.11 
 
 		 177 aa  156  3e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  45.11 
 
 		 177 aa  156  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  45.11 
 
 		 177 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  45.11 
 
 		 177 aa  156  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  45.11 
 
 		 177 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  47.25 
 
 		 176 aa  155  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  41.76 
 
 		 199 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  45.95 
 
 		 177 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  41.9 
 
 		 202 aa  155  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  45.11 
 
 		 177 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  44.51 
 
 		 177 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  42.7 
 
 		 182 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  42.7 
 
 		 182 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  42.7 
 
 		 182 aa  154  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  43.78 
 
 		 183 aa  154  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  43.78 
 
 		 177 aa  153  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  40.11 
 
 		 185 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  43.39 
 
 		 198 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  43.65 
 
 		 177 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  44.51 
 
 		 177 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  44.57 
 
 		 175 aa  152  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  46.6 
 
 		 190 aa  151  8.999999999999999e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  43.09 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>