More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1824 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  100 
 
 		 201 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  65.34 
 
 		 194 aa  247  9e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  65.34 
 
 		 194 aa  246  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  62.36 
 
 		 187 aa  238  5.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  62.86 
 
 		 188 aa  236  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  57.89 
 
 		 177 aa  218  6e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  57.89 
 
 		 177 aa  217  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  57.89 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  57.06 
 
 		 175 aa  211  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  57.31 
 
 		 174 aa  208  4e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  54.39 
 
 		 175 aa  207  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  58.48 
 
 		 175 aa  204  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  56.73 
 
 		 175 aa  203  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  51.53 
 
 		 203 aa  202  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  56.9 
 
 		 181 aa  200  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  52.3 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  56.57 
 
 		 178 aa  197  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  54.91 
 
 		 176 aa  196  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  51.43 
 
 		 177 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  55.17 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  54.39 
 
 		 175 aa  191  6e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  50.29 
 
 		 199 aa  189  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  51.45 
 
 		 177 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  52.02 
 
 		 177 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  51.98 
 
 		 181 aa  188  4e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  52.02 
 
 		 176 aa  188  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  53.18 
 
 		 177 aa  187  7e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  51.41 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  51.41 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  51.41 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  51.41 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  51.41 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  51.41 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  50.29 
 
 		 177 aa  186  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  51.41 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  46.5 
 
 		 202 aa  185  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  56.9 
 
 		 177 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  47 
 
 		 203 aa  184  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  50 
 
 		 243 aa  184  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 185 aa  184  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  48.26 
 
 		 177 aa  184  9e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  48.09 
 
 		 266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  46.51 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3921  transcription antitermination protein NusG  51.45 
 
 		 177 aa  183  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.326446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  49.71 
 
 		 177 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  50.28 
 
 		 185 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  45.71 
 
 		 176 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0393  transcription antitermination protein nusG  50.81 
 
 		 187 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772348 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  48.57 
 
 		 177 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  51.43 
 
 		 178 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  51.72 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  52.02 
 
 		 177 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0472  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.030114  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0442  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.122371  unclonable  0.000000284446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  50.29 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  48.57 
 
 		 198 aa  181  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  49.42 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0475  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 177 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000120697  normal  0.0264815 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4761  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 177 aa  181  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00000265262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  46.24 
 
 		 176 aa  181  8.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  50.87 
 
 		 177 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4560  transcription antitermination protein NusG  50.87 
 
 		 177 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000238123  normal  0.475852 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  51.96 
 
 		 185 aa  181  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  54.39 
 
 		 176 aa  180  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  48.57 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  45.09 
 
 		 176 aa  180  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  45.18 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  45.09 
 
 		 185 aa  180  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  45.18 
 
 		 193 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  48.57 
 
 		 192 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  44.22 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  46.82 
 
 		 176 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0409  transcription antitermination protein NusG  51.72 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00119754  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 177 aa  178  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  48 
 
 		 179 aa  178  4e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  50 
 
 		 182 aa  178  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  49.13 
 
 		 177 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  49.13 
 
 		 177 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  47.78 
 
 		 250 aa  177  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0825  transcription antitermination protein NusG  48.28 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00247224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08710  transcription antitermination protein NusG  48.28 
 
 		 177 aa  177  9e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000110912  hitchhiker  0.00206249 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  51.14 
 
 		 174 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  47.28 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  49.44 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  46.15 
 
 		 276 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  47.06 
 
 		 267 aa  176  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  52.63 
 
 		 172 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  46.82 
 
 		 176 aa  176  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  46.93 
 
 		 266 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  49.44 
 
 		 182 aa  176  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  47.09 
 
 		 175 aa  176  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>