More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0263 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000027375  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  94.97 
 
 		 179 aa  349  8.999999999999999e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2406  transcription antitermination protein NusG  62.92 
 
 		 185 aa  240  9e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00337578  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  54.7 
 
 		 183 aa  197  6e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  53.67 
 
 		 180 aa  195  3e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  52.57 
 
 		 182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  52.57 
 
 		 182 aa  178  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 177 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  52.57 
 
 		 182 aa  178  4e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  49.44 
 
 		 181 aa  177  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1422  transcription antitermination protein nusG  49.16 
 
 		 185 aa  171  5e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.002098  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  48.11 
 
 		 192 aa  168  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  48.86 
 
 		 177 aa  166  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  47.16 
 
 		 194 aa  158  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  48.3 
 
 		 177 aa  157  6e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  47.16 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  47.16 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  47.16 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  47.16 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  47.16 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  47.16 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  47.16 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  47.16 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  46.59 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  47.16 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  44.63 
 
 		 174 aa  151  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  48.86 
 
 		 175 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  44.89 
 
 		 187 aa  150  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  46.33 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  45.29 
 
 		 188 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  46.24 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  46.24 
 
 		 173 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  46.33 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  46.02 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  45.71 
 
 		 175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  44.51 
 
 		 201 aa  142  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  48 
 
 		 175 aa  141  4e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  45.51 
 
 		 181 aa  141  6e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  44.57 
 
 		 178 aa  140  7e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  46.41 
 
 		 174 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  39.55 
 
 		 273 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1021  transcription antitermination protein NusG  41.9 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  42.46 
 
 		 181 aa  139  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  44.25 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  41.81 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  39.55 
 
 		 277 aa  138  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  45.66 
 
 		 174 aa  138  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  39.25 
 
 		 266 aa  137  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  39.78 
 
 		 266 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  40.78 
 
 		 178 aa  134  5e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1041  NusG antitermination factor  39.66 
 
 		 209 aa  134  6.0000000000000005e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0043552  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  39.01 
 
 		 250 aa  134  8e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  41.71 
 
 		 177 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  41.71 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  39.66 
 
 		 242 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  39.89 
 
 		 246 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  39.56 
 
 		 238 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2551  transcription antitermination protein NusG  39.66 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000171979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  41.71 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1741  transcription antitermination protein NusG  40.66 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1765  transcription antitermination protein NusG  40.66 
 
 		 208 aa  132  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000435083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  41.11 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  38.55 
 
 		 242 aa  131  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  36.22 
 
 		 306 aa  130  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0575  NusG antitermination factor  38.22 
 
 		 273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.603721  hitchhiker  0.00747859 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  35.75 
 
 		 238 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  44.38 
 
 		 177 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29880  transcription antitermination protein nusG  37.5 
 
 		 273 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.574847  normal  0.380825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  36.79 
 
 		 272 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  38.71 
 
 		 280 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2954  NusG antitermination factor  35.71 
 
 		 198 aa  129  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000249386  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3694  NusG antitermination factor  42.2 
 
 		 172 aa  129  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000043421  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  35.9 
 
 		 266 aa  128  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0635  transcription antitermination protein NusG  38.55 
 
 		 205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  38.86 
 
 		 188 aa  127  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  36.7 
 
 		 272 aa  127  8.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  37.5 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23990  transcription antitermination protein nusG  38.42 
 
 		 301 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.160343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  35.03 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0909  NusG antitermination factor  43.58 
 
 		 262 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.269153  normal  0.196956 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  42.77 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0294  transcription antitermination protein nusG  41.21 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.620815 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1111  transcription termination/antitermination factor NusG  36.08 
 
 		 299 aa  125  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.106729  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4014  transcription antitermination protein NusG  37.5 
 
 		 217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  37.7 
 
 		 195 aa  124  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1572  transcription antitermination protein NusG  37.57 
 
 		 222 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02811  transcription antitermination protein NusG  37.57 
 
 		 222 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.282538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5965  NusG antitermination factor  35.42 
 
 		 269 aa  124  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.981962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0611  NusG antitermination factor  37.04 
 
 		 265 aa  124  7e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.837872  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  40.12 
 
 		 198 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02231  transcription antitermination protein NusG  39.11 
 
 		 219 aa  124  8.000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0245401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  38.29 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2157  transcription antitermination protein NusG  37.57 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.325374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  34.54 
 
 		 271 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2472  transcription antitermination protein NusG  38.12 
 
 		 222 aa  123  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.469167  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  34.54 
 
 		 270 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  40.12 
 
 		 199 aa  123  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  38.29 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  39.43 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  37.93 
 
 		 178 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>