More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_02811 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_02811  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
222 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.282538  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1572  transcription antitermination protein NusG  98.65 
 
 
222 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02231  transcription antitermination protein NusG  81.17 
 
 
219 aa  371  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0245401  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27761  transcription antitermination protein NusG  80.72 
 
 
241 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2157  transcription antitermination protein NusG  84.36 
 
 
222 aa  363  1e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.325374  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2472  transcription antitermination protein NusG  92.93 
 
 
222 aa  357  9.999999999999999e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.469167  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02341  transcription antitermination protein NusG  85.13 
 
 
203 aa  354  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.750584  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02231  transcription antitermination protein NusG  85.13 
 
 
203 aa  354  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.534603  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02251  transcription antitermination protein NusG  85.13 
 
 
203 aa  354  5.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0781907  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0207  transcription antitermination protein NusG  85.13 
 
 
203 aa  353  8.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0563762  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0635  transcription antitermination protein NusG  67.5 
 
 
205 aa  286  1e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471778  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2551  transcription antitermination protein NusG  68.11 
 
 
210 aa  276  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000171979  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1021  transcription antitermination protein NusG  68.11 
 
 
213 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1041  NusG antitermination factor  67.57 
 
 
209 aa  269  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0043552  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1765  transcription antitermination protein NusG  60.19 
 
 
208 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000435083  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1741  transcription antitermination protein NusG  60.19 
 
 
208 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0266  transcription antitermination protein NusG  61.34 
 
 
224 aa  249  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00474439  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4014  transcription antitermination protein NusG  60.41 
 
 
217 aa  246  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  45.41 
 
 
178 aa  160  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  45.45 
 
 
178 aa  157  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  40.66 
 
 
175 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  45.41 
 
 
176 aa  152  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  43.01 
 
 
181 aa  149  4e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  40.66 
 
 
174 aa  148  6e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  42.31 
 
 
201 aa  147  9e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  42.22 
 
 
180 aa  144  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  40.88 
 
 
177 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  40.88 
 
 
175 aa  142  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  38.83 
 
 
243 aa  142  5e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  37.07 
 
 
203 aa  141  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  39.29 
 
 
266 aa  141  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  40.82 
 
 
242 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  37.06 
 
 
194 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  40.31 
 
 
242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  41.21 
 
 
181 aa  138  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  39.56 
 
 
182 aa  137  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  39.56 
 
 
182 aa  137  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  37.77 
 
 
194 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  38.46 
 
 
178 aa  137  1e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  36.65 
 
 
187 aa  137  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  38.25 
 
 
188 aa  135  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  40.76 
 
 
177 aa  134  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  37.44 
 
 
272 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  38.12 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  38.02 
 
 
238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  40.11 
 
 
273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  39.57 
 
 
176 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  41.44 
 
 
177 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  37.91 
 
 
182 aa  132  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  40.22 
 
 
177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  40.22 
 
 
177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  40.1 
 
 
238 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  40.76 
 
 
177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  40.76 
 
 
177 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  38.46 
 
 
173 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  35.95 
 
 
270 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  41.08 
 
 
179 aa  132  5e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  35.95 
 
 
270 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  39.23 
 
 
175 aa  131  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  35.29 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  35.81 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  39.67 
 
 
177 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  39.38 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  39.78 
 
 
177 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  38.14 
 
 
277 aa  129  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  39.58 
 
 
250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  39.13 
 
 
177 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  38.59 
 
 
176 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  39.56 
 
 
175 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  40.22 
 
 
176 aa  129  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  36.36 
 
 
195 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  40.84 
 
 
185 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  37.73 
 
 
306 aa  128  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  40.76 
 
 
177 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  38.59 
 
 
196 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  38.59 
 
 
196 aa  127  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  37.76 
 
 
280 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  38.55 
 
 
179 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  35.43 
 
 
271 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  38.38 
 
 
267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  34.95 
 
 
183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  37.7 
 
 
174 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  39.23 
 
 
177 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  39.23 
 
 
177 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  39.23 
 
 
177 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  39.23 
 
 
177 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  34.9 
 
 
189 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  39.23 
 
 
177 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  39.23 
 
 
177 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  39.23 
 
 
177 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  38.34 
 
 
246 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  39.23 
 
 
177 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  39.23 
 
 
177 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2684  NusG antitermination factor  36.96 
 
 
191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000736005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0742  NusG antitermination factor  38.3 
 
 
179 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  38.46 
 
 
176 aa  125  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  39.13 
 
 
177 aa  126  3e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  38.17 
 
 
185 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  39.57 
 
 
176 aa  126  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  39.79 
 
 
185 aa  125  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>