More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4014 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4014  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 		 217 aa  441  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1021  transcription antitermination protein NusG  73.2 
 
 		 213 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1041  NusG antitermination factor  72.16 
 
 		 209 aa  286  2e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0043552  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0266  transcription antitermination protein NusG  69.79 
 
 		 224 aa  283  1.0000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00474439  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2551  transcription antitermination protein NusG  70.62 
 
 		 210 aa  281  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000171979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1741  transcription antitermination protein NusG  68.84 
 
 		 208 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1765  transcription antitermination protein NusG  68.84 
 
 		 208 aa  280  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000435083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0635  transcription antitermination protein NusG  68.18 
 
 		 205 aa  276  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02231  transcription antitermination protein NusG  62.44 
 
 		 219 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0245401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2157  transcription antitermination protein NusG  62.44 
 
 		 222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.325374  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27761  transcription antitermination protein NusG  61.42 
 
 		 241 aa  251  5.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02811  transcription antitermination protein NusG  60.41 
 
 		 222 aa  246  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.282538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1572  transcription antitermination protein NusG  60.41 
 
 		 222 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2472  transcription antitermination protein NusG  61.54 
 
 		 222 aa  247  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.469167  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02251  transcription antitermination protein NusG  56.68 
 
 		 203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0781907  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0207  transcription antitermination protein NusG  55.76 
 
 		 203 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0563762  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02341  transcription antitermination protein NusG  56.22 
 
 		 203 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.750584  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02231  transcription antitermination protein NusG  55.76 
 
 		 203 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.534603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  39.18 
 
 		 175 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  40.21 
 
 		 174 aa  147  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  40.93 
 
 		 201 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  36.6 
 
 		 175 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  39.18 
 
 		 178 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  41.75 
 
 		 185 aa  142  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  38.66 
 
 		 177 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  38.66 
 
 		 177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  38.14 
 
 		 177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  37.13 
 
 		 188 aa  139  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  37.63 
 
 		 194 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  39.39 
 
 		 181 aa  138  6e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  38.14 
 
 		 175 aa  137  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  40.72 
 
 		 185 aa  136  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  38.46 
 
 		 176 aa  136  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  38.07 
 
 		 178 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  38.66 
 
 		 182 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  36.6 
 
 		 194 aa  135  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  38.66 
 
 		 182 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  36.08 
 
 		 187 aa  134  9e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  39.59 
 
 		 178 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  35.93 
 
 		 272 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  38.86 
 
 		 181 aa  133  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  40.4 
 
 		 243 aa  133  3e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  37.81 
 
 		 267 aa  132  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  39.5 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  38.14 
 
 		 182 aa  131  6.999999999999999e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  37.44 
 
 		 179 aa  131  9e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  36.76 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  36 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2201  transcription antitermination protein NusG  36.04 
 
 		 185 aa  129  3e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  35.71 
 
 		 175 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  38.86 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  37.76 
 
 		 176 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  35.75 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  36.59 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  35.94 
 
 		 180 aa  128  6e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  36.22 
 
 		 192 aa  128  8.000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  34.88 
 
 		 266 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  35.57 
 
 		 175 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  36.32 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2112  transcription antitermination protein NusG  35.53 
 
 		 185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000834658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  35.64 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  35.64 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  35.64 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  35.64 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  35.64 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  35.64 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  35.64 
 
 		 185 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  39.29 
 
 		 176 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  35.64 
 
 		 185 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  36.71 
 
 		 280 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  36.98 
 
 		 242 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  36.98 
 
 		 242 aa  126  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2062  transcription antitermination protein NusG  38.54 
 
 		 179 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  35.64 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  35.64 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  35.64 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  38.31 
 
 		 250 aa  125  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  35.64 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  35.64 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  35.64 
 
 		 185 aa  125  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0263  transcription antitermination protein NusG  37.5 
 
 		 179 aa  125  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000027375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  35.61 
 
 		 276 aa  124  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  35.21 
 
 		 270 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  34.74 
 
 		 271 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  35.21 
 
 		 270 aa  124  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  34.9 
 
 		 173 aa  124  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  35.71 
 
 		 177 aa  124  9e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  34.31 
 
 		 194 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  35.68 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  35.68 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  35.05 
 
 		 177 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  36.87 
 
 		 177 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  35.05 
 
 		 177 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  35.05 
 
 		 197 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  35.68 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  35.68 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  36.08 
 
 		 177 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  36.22 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0744  transcription antitermination protein NusG  37.56 
 
 		 186 aa  122  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000594191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2972  transcription antitermination protein NusG  35.02 
 
 		 194 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.65694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>