More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0635 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0635  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2551  transcription antitermination protein NusG  73.3 
 
 		 210 aa  317  7e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000171979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1021  transcription antitermination protein NusG  79.46 
 
 		 213 aa  313  9.999999999999999e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1041  NusG antitermination factor  77.78 
 
 		 209 aa  313  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0043552  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1741  transcription antitermination protein NusG  72.91 
 
 		 208 aa  312  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1765  transcription antitermination protein NusG  72.91 
 
 		 208 aa  312  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000435083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02231  transcription antitermination protein NusG  76.22 
 
 		 219 aa  297  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0245401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27761  transcription antitermination protein NusG  75.68 
 
 		 241 aa  292  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0266  transcription antitermination protein NusG  71.36 
 
 		 224 aa  292  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00474439  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2157  transcription antitermination protein NusG  70 
 
 		 222 aa  290  1e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.325374  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02811  transcription antitermination protein NusG  67.5 
 
 		 222 aa  286  1e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.282538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1572  transcription antitermination protein NusG  67.5 
 
 		 222 aa  286  2e-76  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2472  transcription antitermination protein NusG  68.97 
 
 		 222 aa  285  2.9999999999999996e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.469167  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02251  transcription antitermination protein NusG  66.34 
 
 		 203 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0781907  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0207  transcription antitermination protein NusG  66.34 
 
 		 203 aa  279  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0563762  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02231  transcription antitermination protein NusG  65.85 
 
 		 203 aa  278  4e-74  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.534603  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02341  transcription antitermination protein NusG  71.89 
 
 		 203 aa  278  4e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.750584  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4014  transcription antitermination protein NusG  68.18 
 
 		 217 aa  276  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  42.31 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  45.41 
 
 		 178 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  44.51 
 
 		 201 aa  160  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  41.76 
 
 		 174 aa  160  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  44.26 
 
 		 176 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  42.16 
 
 		 175 aa  158  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  40.11 
 
 		 178 aa  157  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  39.8 
 
 		 188 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  44.2 
 
 		 177 aa  154  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  37.93 
 
 		 194 aa  154  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  43.78 
 
 		 178 aa  154  9e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  37.44 
 
 		 194 aa  154  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  44.2 
 
 		 177 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  43.65 
 
 		 177 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  44.81 
 
 		 181 aa  152  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  43.01 
 
 		 181 aa  152  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  41.75 
 
 		 266 aa  152  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  43.37 
 
 		 280 aa  152  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  42.39 
 
 		 180 aa  151  5.9999999999999996e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  43.92 
 
 		 185 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  43.23 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  42.86 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  42.86 
 
 		 182 aa  149  3e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  41.75 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  40.66 
 
 		 203 aa  148  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  42.86 
 
 		 238 aa  148  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  38.71 
 
 		 187 aa  148  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  42.86 
 
 		 182 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  41.36 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  42.71 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  42.39 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  40.76 
 
 		 177 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  40.88 
 
 		 175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  41.44 
 
 		 177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  42.7 
 
 		 174 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  39.46 
 
 		 176 aa  146  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  41.4 
 
 		 177 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  41.62 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  41.8 
 
 		 185 aa  145  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  39.56 
 
 		 175 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  38.16 
 
 		 197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  38.05 
 
 		 266 aa  144  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  40.54 
 
 		 175 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  39.68 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  38.54 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  39.56 
 
 		 173 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  40.54 
 
 		 175 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  39.34 
 
 		 306 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  41.4 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  39.69 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  41.4 
 
 		 181 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  38.61 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  39.69 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  38.54 
 
 		 276 aa  142  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  39.69 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  38.61 
 
 		 271 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  39.89 
 
 		 180 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  41.85 
 
 		 176 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  39.69 
 
 		 185 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  38.61 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  40 
 
 		 243 aa  142  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  38.54 
 
 		 193 aa  142  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  39.67 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  40.91 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  39.18 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  40.22 
 
 		 177 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  39.18 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  39.18 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  39.18 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  39.18 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  39.18 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  39.18 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  40.22 
 
 		 177 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  39.01 
 
 		 175 aa  141  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0136  NusG antitermination factor  38.42 
 
 		 183 aa  141  8e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  39.18 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  39.18 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  39.18 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  39.18 
 
 		 185 aa  140  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  40.86 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  40.86 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2805  transcription antitermination protein NusG  41.4 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375303  normal  0.085047 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>