More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0266 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0266  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 
224 aa  460  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00474439  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1021  transcription antitermination protein NusG  75.77 
 
 
213 aa  305  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2551  transcription antitermination protein NusG  71.71 
 
 
210 aa  303  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000171979  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1041  NusG antitermination factor  70.73 
 
 
209 aa  296  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0043552  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0635  transcription antitermination protein NusG  71.36 
 
 
205 aa  292  3e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471778  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1765  transcription antitermination protein NusG  63.06 
 
 
208 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000435083  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1741  transcription antitermination protein NusG  63.06 
 
 
208 aa  287  1e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4014  transcription antitermination protein NusG  69.79 
 
 
217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02231  transcription antitermination protein NusG  58.96 
 
 
219 aa  253  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0245401  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2157  transcription antitermination protein NusG  62.89 
 
 
222 aa  253  2.0000000000000002e-66  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.325374  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1572  transcription antitermination protein NusG  61.34 
 
 
222 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27761  transcription antitermination protein NusG  58.1 
 
 
241 aa  249  2e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02811  transcription antitermination protein NusG  61.34 
 
 
222 aa  249  3e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.282538  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2472  transcription antitermination protein NusG  61.34 
 
 
222 aa  248  4e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.469167  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02231  transcription antitermination protein NusG  61.86 
 
 
203 aa  243  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.534603  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0207  transcription antitermination protein NusG  61.86 
 
 
203 aa  243  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0563762  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02251  transcription antitermination protein NusG  58.77 
 
 
203 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0781907  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02341  transcription antitermination protein NusG  61.86 
 
 
203 aa  242  3e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.750584  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  40.31 
 
 
175 aa  160  1e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  41.24 
 
 
201 aa  156  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  40 
 
 
174 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  38.54 
 
 
175 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  40.3 
 
 
194 aa  151  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  39.8 
 
 
178 aa  150  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  40.21 
 
 
176 aa  149  4e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2201  transcription antitermination protein NusG  42.05 
 
 
185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000256386  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  39.3 
 
 
194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  38.05 
 
 
187 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  41.84 
 
 
177 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  42.35 
 
 
177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2112  transcription antitermination protein NusG  41.54 
 
 
185 aa  145  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000834658  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  37.31 
 
 
178 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  41.62 
 
 
179 aa  144  9e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  39.06 
 
 
175 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  38.35 
 
 
188 aa  143  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0744  transcription antitermination protein NusG  43.59 
 
 
186 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000594191  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  41.03 
 
 
177 aa  142  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  41.15 
 
 
177 aa  142  5e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  40.54 
 
 
250 aa  142  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  41.15 
 
 
177 aa  142  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  41.15 
 
 
177 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  38.22 
 
 
280 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  40.31 
 
 
177 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  40.31 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04536  transcription antitermination protein NusG  42.05 
 
 
185 aa  139  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.408108  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  40.31 
 
 
181 aa  139  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  39.8 
 
 
181 aa  139  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  38.27 
 
 
178 aa  139  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  39.51 
 
 
266 aa  138  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  39.41 
 
 
183 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0136  NusG antitermination factor  37.44 
 
 
183 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000274411  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4329  NusG antitermination factor  38.92 
 
 
183 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000065431  hitchhiker  0.00000000191931 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  39.8 
 
 
185 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  41.54 
 
 
177 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  39.29 
 
 
177 aa  137  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  37.63 
 
 
180 aa  137  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0172  NusG antitermination factor  38.92 
 
 
183 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000325102  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  38 
 
 
190 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0201  transcription antitermination protein NusG  38.92 
 
 
183 aa  137  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538288  hitchhiker  0.00010102 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  39.8 
 
 
175 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  36.79 
 
 
203 aa  136  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0187  transcription antitermination protein nusG  39.9 
 
 
183 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000254051  normal  0.0190585 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  41.41 
 
 
243 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  41.03 
 
 
181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  41.03 
 
 
181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  41.03 
 
 
181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  41.03 
 
 
181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  39.11 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  41.03 
 
 
181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  41.03 
 
 
181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  41.03 
 
 
181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0158  transcription termination/antitermination factor NusG  38.46 
 
 
183 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000171251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  41.03 
 
 
181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  41.03 
 
 
181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0146  NusG antitermination factor  40 
 
 
180 aa  135  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000173451  normal  0.0355944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  38.53 
 
 
203 aa  135  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  36.27 
 
 
175 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  38 
 
 
197 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  38.27 
 
 
182 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  39 
 
 
194 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  38.27 
 
 
182 aa  135  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  41.54 
 
 
176 aa  135  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3771  NusG antitermination factor  39.41 
 
 
183 aa  134  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  40 
 
 
177 aa  134  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  40.31 
 
 
177 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4777  transcription termination/antitermination factor NusG  38.46 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0219  transcription antitermination protein NusG  39.41 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4470  NusG antitermination factor  38.92 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0188  NusG antitermination factor  38.92 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000173496  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  37 
 
 
190 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  38.27 
 
 
175 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  37.26 
 
 
193 aa  134  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0707  transcription antitermination protein NusG  38.97 
 
 
177 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0627927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  40.51 
 
 
181 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0187  transcription antitermination protein nusG  39.41 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000177465  hitchhiker  0.00840518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0182  transcription antitermination protein nusG  39.41 
 
 
183 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000371558  normal  0.0116836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  40.51 
 
 
181 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  40.51 
 
 
181 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  38.27 
 
 
175 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  40.51 
 
 
181 aa  134  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>