More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_27761 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_27761  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 		 241 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2157  transcription antitermination protein NusG  89.5 
 
 		 222 aa  401  1e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.325374  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02231  transcription antitermination protein NusG  85.65 
 
 		 219 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0245401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2472  transcription antitermination protein NusG  87.67 
 
 		 222 aa  382  1e-105  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.469167  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1572  transcription antitermination protein NusG  80.72 
 
 		 222 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02811  transcription antitermination protein NusG  80.72 
 
 		 222 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.282538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0207  transcription antitermination protein NusG  82.74 
 
 		 203 aa  348  3e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0563762  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02341  transcription antitermination protein NusG  85.26 
 
 		 203 aa  348  6e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.750584  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02231  transcription antitermination protein NusG  82.23 
 
 		 203 aa  348  6e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.534603  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02251  transcription antitermination protein NusG  82.23 
 
 		 203 aa  347  7e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0781907  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0635  transcription antitermination protein NusG  75.68 
 
 		 205 aa  292  3e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2551  transcription antitermination protein NusG  69.52 
 
 		 210 aa  282  3.0000000000000004e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000171979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1041  NusG antitermination factor  67.57 
 
 		 209 aa  273  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0043552  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1021  transcription antitermination protein NusG  69.19 
 
 		 213 aa  272  3e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1765  transcription antitermination protein NusG  60.19 
 
 		 208 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000435083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1741  transcription antitermination protein NusG  60.19 
 
 		 208 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4014  transcription antitermination protein NusG  61.42 
 
 		 217 aa  251  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0266  transcription antitermination protein NusG  58.1 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00474439  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  45.41 
 
 		 178 aa  161  7e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  40.66 
 
 		 175 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  44.32 
 
 		 178 aa  150  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  44.86 
 
 		 176 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  43.09 
 
 		 181 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  40.66 
 
 		 174 aa  149  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  42.31 
 
 		 201 aa  149  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  40.88 
 
 		 175 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  38.34 
 
 		 203 aa  142  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  40.33 
 
 		 180 aa  142  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  39.78 
 
 		 177 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  40.11 
 
 		 173 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  37.2 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  37.36 
 
 		 178 aa  138  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  38.19 
 
 		 188 aa  138  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  40.11 
 
 		 182 aa  138  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  40.11 
 
 		 182 aa  138  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  39.49 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  39.44 
 
 		 181 aa  136  3.0000000000000003e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  40.54 
 
 		 176 aa  136  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  36.98 
 
 		 194 aa  136  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  39.56 
 
 		 182 aa  135  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  41.3 
 
 		 176 aa  135  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  40.76 
 
 		 177 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  40.76 
 
 		 177 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  39.78 
 
 		 175 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  36.81 
 
 		 187 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  37.36 
 
 		 194 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  40.41 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  40.41 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  40.22 
 
 		 177 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  38.39 
 
 		 202 aa  133  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  39.6 
 
 		 266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  41.44 
 
 		 177 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  42.33 
 
 		 185 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  39.67 
 
 		 177 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  40.54 
 
 		 179 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  38.27 
 
 		 238 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  36.36 
 
 		 196 aa  131  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  40.22 
 
 		 177 aa  131  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  40.22 
 
 		 177 aa  131  9e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  41.3 
 
 		 177 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  37.81 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  38.46 
 
 		 175 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  35.86 
 
 		 196 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  38.59 
 
 		 176 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  37.24 
 
 		 197 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  38.58 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  39.8 
 
 		 238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  38.59 
 
 		 176 aa  128  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  35.33 
 
 		 183 aa  128  6e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  39.04 
 
 		 273 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  36.49 
 
 		 203 aa  128  9.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  36.36 
 
 		 195 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  37.98 
 
 		 306 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2684  NusG antitermination factor  36.96 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000736005  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  39.13 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  36.96 
 
 		 176 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  38.5 
 
 		 176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  38.59 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  39.13 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  38.58 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  36.89 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  36.89 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  37.91 
 
 		 176 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  36.59 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  40.22 
 
 		 177 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0352  NusG antitermination factor  36.96 
 
 		 191 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000459133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  40.44 
 
 		 174 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  38.04 
 
 		 177 aa  126  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  38.12 
 
 		 177 aa  126  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  38.25 
 
 		 180 aa  126  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  38.12 
 
 		 177 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  39.06 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  36.71 
 
 		 193 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  36.71 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  38.59 
 
 		 174 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  37.04 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0193  transcription antitermination protein NusG  39.47 
 
 		 184 aa  125  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000930263  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  36.41 
 
 		 185 aa  125  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0614  transcription antitermination protein NusG  39.13 
 
 		 177 aa  125  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  41.27 
 
 		 185 aa  125  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>