More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_02341 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_02341  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.750584  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0207  transcription antitermination protein NusG  97.54 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0563762  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02231  transcription antitermination protein NusG  98.03 
 
 		 203 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.534603  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02251  transcription antitermination protein NusG  97.04 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0781907  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02811  transcription antitermination protein NusG  85.13 
 
 		 222 aa  354  3.9999999999999996e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.282538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1572  transcription antitermination protein NusG  82.18 
 
 		 222 aa  354  5e-97  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02231  transcription antitermination protein NusG  87.11 
 
 		 219 aa  353  1e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0245401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2157  transcription antitermination protein NusG  86.84 
 
 		 222 aa  349  2e-95  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.325374  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27761  transcription antitermination protein NusG  85.26 
 
 		 241 aa  348  4e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2472  transcription antitermination protein NusG  85.87 
 
 		 222 aa  337  7e-92  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.469167  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0635  transcription antitermination protein NusG  71.89 
 
 		 205 aa  278  4e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2551  transcription antitermination protein NusG  65.95 
 
 		 210 aa  269  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000171979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1021  transcription antitermination protein NusG  69.57 
 
 		 213 aa  266  1e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1041  NusG antitermination factor  65.95 
 
 		 209 aa  263  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0043552  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1765  transcription antitermination protein NusG  62.87 
 
 		 208 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000435083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1741  transcription antitermination protein NusG  62.87 
 
 		 208 aa  259  2e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0266  transcription antitermination protein NusG  61.86 
 
 		 224 aa  242  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00474439  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4014  transcription antitermination protein NusG  56.22 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  45.41 
 
 		 178 aa  157  9e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  44.32 
 
 		 178 aa  147  8e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  40.11 
 
 		 175 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  45.9 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  44.09 
 
 		 181 aa  144  9e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  40.11 
 
 		 174 aa  143  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  41.44 
 
 		 177 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  41.76 
 
 		 201 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  40.11 
 
 		 178 aa  136  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  41.76 
 
 		 182 aa  134  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  41.76 
 
 		 182 aa  134  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  41.27 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  38.12 
 
 		 180 aa  132  3e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  39.44 
 
 		 181 aa  132  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  39.34 
 
 		 203 aa  132  3e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  38.12 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  36.46 
 
 		 175 aa  132  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  37.11 
 
 		 266 aa  132  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  39.56 
 
 		 173 aa  131  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  40.22 
 
 		 177 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  39.8 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  39.8 
 
 		 242 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  40.11 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  40.88 
 
 		 177 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  36.26 
 
 		 194 aa  128  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  40 
 
 		 179 aa  128  6e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  40.22 
 
 		 177 aa  128  7.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  39.13 
 
 		 177 aa  127  8.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  35.71 
 
 		 194 aa  127  9.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2167  transcription antitermination protein nusG  38.1 
 
 		 176 aa  127  9.000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  39.13 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0090  transcription antitermination protein NusG  39.23 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000996375  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  35.16 
 
 		 187 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  39.13 
 
 		 177 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  39.13 
 
 		 177 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  39.13 
 
 		 199 aa  126  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  37.37 
 
 		 238 aa  125  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3251  NusG antitermination factor  38.04 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3902  transcription antitermination protein nusG  38.04 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  40.22 
 
 		 176 aa  125  5e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  38.14 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  36.23 
 
 		 197 aa  124  7e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  40.32 
 
 		 177 aa  124  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  39.04 
 
 		 176 aa  124  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  40.98 
 
 		 174 aa  124  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0096  transcription antitermination protein NusG  38.67 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000261698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  39.68 
 
 		 185 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0096  transcription antitermination protein NusG  38.67 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000132326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0092  transcription antitermination protein NusG  38.67 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  6.07687e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0090  transcription antitermination protein NusG  38.67 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176433  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5210  transcription antitermination protein NusG  38.67 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000809778  unclonable  4.0608300000000004e-26 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0283  NusG antitermination factor  38.59 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000912407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0096  transcription antitermination protein NusG  38.67 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000457799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0116  transcription antitermination protein NusG  38.67 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000109294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0091  transcription antitermination protein NusG  38.67 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481772  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  37.57 
 
 		 175 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0126  transcription antitermination protein NusG  38.67 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  39.13 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  35.33 
 
 		 183 aa  123  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0742  NusG antitermination factor  40.43 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  38.04 
 
 		 177 aa  122  3e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  37.11 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  40.11 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  37.31 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  37.31 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  38.04 
 
 		 176 aa  121  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  36.92 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  37.91 
 
 		 175 aa  121  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1061  transcription antitermination protein NusG  39.13 
 
 		 177 aa  121  8e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0756818  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  36.76 
 
 		 273 aa  121  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  35.53 
 
 		 185 aa  121  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  40.44 
 
 		 172 aa  121  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  35.87 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  37.5 
 
 		 250 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  36.08 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  35.86 
 
 		 267 aa  120  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0193  transcription antitermination protein NusG  38.22 
 
 		 184 aa  120  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000930263  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  36.22 
 
 		 280 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4702  NusG antitermination factor  36.65 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000069225  hitchhiker  0.0000042395 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  31.82 
 
 		 195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  38.17 
 
 		 176 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  35.12 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>