More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_1021 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_1021  transcription antitermination protein NusG  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0111232 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1765  transcription antitermination protein NusG  81.52 
 
 		 208 aa  346  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000435083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1741  transcription antitermination protein NusG  81.52 
 
 		 208 aa  346  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1041  NusG antitermination factor  76.53 
 
 		 209 aa  328  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0043552  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2551  transcription antitermination protein NusG  75.59 
 
 		 210 aa  328  4e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000171979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0635  transcription antitermination protein NusG  79.46 
 
 		 205 aa  314  5e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0471778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0266  transcription antitermination protein NusG  68.61 
 
 		 224 aa  308  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00474439  normal  0.0246863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4014  transcription antitermination protein NusG  73.2 
 
 		 217 aa  286  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  hitchhiker  0.000000338783 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02231  transcription antitermination protein NusG  70.11 
 
 		 219 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0245401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27761  transcription antitermination protein NusG  68.25 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2157  transcription antitermination protein NusG  69.57 
 
 		 222 aa  272  3e-72  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.325374  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1572  transcription antitermination protein NusG  68.11 
 
 		 222 aa  270  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02811  transcription antitermination protein NusG  62.98 
 
 		 222 aa  270  1e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.282538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2472  transcription antitermination protein NusG  69.02 
 
 		 222 aa  269  2e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.469167  normal  0.0838688 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0207  transcription antitermination protein NusG  69.02 
 
 		 203 aa  266  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0563762  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02341  transcription antitermination protein NusG  69.57 
 
 		 203 aa  266  1e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.750584  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02251  transcription antitermination protein NusG  69.02 
 
 		 203 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0781907  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02231  transcription antitermination protein NusG  69.02 
 
 		 203 aa  266  2e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.534603  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  46.7 
 
 		 174 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  43.96 
 
 		 175 aa  175  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  44.26 
 
 		 175 aa  170  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  43.41 
 
 		 178 aa  167  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  45.03 
 
 		 194 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  42.27 
 
 		 187 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  44.75 
 
 		 175 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  44.51 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  45.95 
 
 		 181 aa  159  2e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  44.68 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  40.19 
 
 		 203 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  44.68 
 
 		 182 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  46.41 
 
 		 181 aa  159  4e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  42.05 
 
 		 188 aa  158  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  43.15 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  42.7 
 
 		 178 aa  158  7e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  45.16 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  44.15 
 
 		 182 aa  157  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  42.62 
 
 		 176 aa  157  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  45.16 
 
 		 177 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  42.86 
 
 		 175 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  44.51 
 
 		 176 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  44.62 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  41.01 
 
 		 250 aa  155  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  43.24 
 
 		 178 aa  155  4e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  43.65 
 
 		 177 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6641  NusG antitermination factor  42.23 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5117  transcription antitermination protein NusG  39.15 
 
 		 272 aa  154  6e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1068  Transcription antiterminator-like protein  39.6 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.740991 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  42.31 
 
 		 175 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10652  transcription antitermination protein NusG  40.3 
 
 		 238 aa  152  4e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0333893 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1234  transcription antitermination protein NusG  38.32 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0922  transcription antitermination protein NusG  38.5 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0939  transcription antitermination protein NusG  38.5 
 
 		 270 aa  150  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0950  transcription antitermination protein NusG  38.03 
 
 		 271 aa  149  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4356  NusG antitermination factor  41.38 
 
 		 238 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0741  NusG antitermination factor  37.61 
 
 		 276 aa  150  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  43.32 
 
 		 174 aa  150  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  44.39 
 
 		 243 aa  149  2e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  44.02 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1322  NusG antitermination factor  41.21 
 
 		 173 aa  149  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  40.19 
 
 		 280 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  42.39 
 
 		 177 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  43.48 
 
 		 202 aa  148  5e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  42.93 
 
 		 190 aa  148  7e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  44.02 
 
 		 177 aa  148  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  38.76 
 
 		 197 aa  147  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  43.55 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  43.55 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  43.55 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0307  transcription antitermination protein nusG  40.33 
 
 		 180 aa  147  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000733893  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  43.55 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  43.55 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  43.55 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  43.55 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  43.55 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03630  transcription antitermination protein nusG  42.71 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  43.55 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  43.55 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  43.55 
 
 		 181 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  41.71 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  41.71 
 
 		 242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  39.09 
 
 		 306 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  44.81 
 
 		 174 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  41.41 
 
 		 193 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0870  NusG antitermination factor  41.85 
 
 		 177 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  44.02 
 
 		 203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  41.41 
 
 		 193 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  43.92 
 
 		 185 aa  145  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0267  transcription antitermination protein nusG  42.7 
 
 		 179 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00185967  hitchhiker  0.0014194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0307  transcription antitermination protein NusG  43.48 
 
 		 177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000168566  normal  0.0486415 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0355  transcription antiterminator  41.4 
 
 		 183 aa  145  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000436573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4390  transcription antitermination protein NusG  43.01 
 
 		 181 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826486  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4554  transcription antitermination protein NusG  43.01 
 
 		 181 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0154777  hitchhiker  0.000000000000240769 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  42.39 
 
 		 190 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4477  transcription antitermination protein NusG  43.01 
 
 		 181 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00122338  hitchhiker  0.00131185 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4358  transcription antitermination protein NusG  43.01 
 
 		 181 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00203543  normal  0.568115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  43.01 
 
 		 181 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0537  NusG antitermination factor  41.18 
 
 		 246 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  hitchhiker  0.00572765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0334  transcription antitermination protein NusG  43.01 
 
 		 181 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111742  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4525  NusG antitermination factor  37.1 
 
 		 272 aa  144  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3865  transcription antitermination protein NusG  43.01 
 
 		 181 aa  144  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  8.284e-17  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>