More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1705 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1705  NusG antitermination factor  100 
 
 		 173 aa  343  8e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0707648  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4091  hypothetical protein  38.79 
 
 		 174 aa  98.6  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.177028 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0093  transcription antitermination protein nusG  35.19 
 
 		 177 aa  87.8  7e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3226  transcriptional activator RfaH  33.92 
 
 		 170 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.493951 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0891  transcriptional activator  33.95 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2544  NusG antitermination factor  28.05 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3466  NusG antitermination factor  28.48 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1124  transcriptional activator RfaH  33.33 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  33.71 
 
 		 185 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1374  transcription antitermination protein nusG  27.56 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000814975  hitchhiker  0.00000420235 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  33.71 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  25.29 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2672  transcriptional activator RfaH  31.95 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000489964  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1314  transcription antitermination protein nusG  28.38 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0397005  normal  0.368263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1381  transcription antitermination protein nusG  28.38 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111282  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2803  NusG antitermination factor  29.01 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  29.38 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3033  NusG antitermination factor  28.99 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.201282  hitchhiker  0.00738104 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2484  transcriptional activator RfaH  31.71 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  27.27 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  25.28 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  31.76 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2265  transcriptional activator rfaH, putative  30.72 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000106043  hitchhiker  0.00695369 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  29.94 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  29.94 
 
 		 176 aa  74.7  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1321  transcription antitermination protein NusG  30.18 
 
 		 176 aa  73.9  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000116235  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  28.98 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3194  transcriptional activator rfaH, putative  28.86 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  30.9 
 
 		 176 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1699  NusG antitermination factor  26.99 
 
 		 212 aa  73.9  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2904  transcriptional acivator RfaH  26.22 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00160957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1469  transcriptional acivator RfaH  26.22 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000410204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  25.57 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3444  transcriptional activator RfaH  34.12 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1668  transcription antitermination protein NusG  27.81 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0130356  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  31.18 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  27.84 
 
 		 175 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2142  transcription antitermination protein nusG  32.48 
 
 		 182 aa  73.2  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.592011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  32.82 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  28.81 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3036  transcriptional acivator RfaH  26.22 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00758207  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2894  transcriptional acivator RfaH  25.61 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000245267  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  27.84 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  31.18 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  26.29 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  26.26 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  27.17 
 
 		 203 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1953  NusG antitermination factor  26.49 
 
 		 195 aa  72  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00519694  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  28.81 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  31.18 
 
 		 176 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1650  transcriptional acivator RfaH  30.36 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0204524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  25.86 
 
 		 189 aa  71.2  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  27.84 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  31.41 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  29.94 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  31.18 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  27.84 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  27.84 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  26.97 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  30.41 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2265  NusG antitermination factor  31.71 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  26.7 
 
 		 199 aa  69.3  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0176  transcription antitermination protein NusG  28.4 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0141603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  26.7 
 
 		 175 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  32.69 
 
 		 177 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  25.99 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  29.94 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  28.49 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15910  transcriptional activator RfaH  29.45 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  28.81 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  32.69 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  27.93 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  27.93 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  27.93 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  28.81 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1492  NusG antitermination factor  27.43 
 
 		 178 aa  67.4  0.00000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.509367  normal  0.372591 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  26.4 
 
 		 177 aa  67.4  0.00000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3755  transcriptional activator RfaH  30.87 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3907  transcriptional activator RfaH  30.34 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.519229  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0742  NusG antitermination factor  29.82 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0172264 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  28.81 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0200  transcription antitermination protein NusG  29.03 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  28.81 
 
 		 176 aa  65.9  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1375  NusG antitermination factor  27.89 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  28.39 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  24.43 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  30.99 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  28.39 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  28.65 
 
 		 177 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4222  transcriptional activator RfaH  27.81 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00601937 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0205  transcription antitermination protein NusG  29.03 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000145742  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3953  transcriptional activator RfaH  30.43 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.038453 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1398  NusG antitermination factor  25.88 
 
 		 175 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000128095  normal  0.158725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0256  transcriptional activator RfaH  28.21 
 
 		 162 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.108005 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  28.8 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  27.46 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  30.99 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  24.28 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  30.99 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0887  transcription antitermination protein nusG  30.54 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.769632  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>