More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1492 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1492  NusG antitermination factor  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.509367  normal  0.372591 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  48.28 
 
 		 175 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  49.14 
 
 		 175 aa  177  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5088  transcription antitermination protein NusG  49.72 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120932  normal  0.503676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  48.3 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1345  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2276  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.136705  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3359  NusG antitermination factor  49.43 
 
 		 176 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.16997 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2724  NusG antitermination factor  48.85 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0514206  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3693  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 176 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0367  NusG antitermination factor  48.3 
 
 		 177 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527388  normal  0.813654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3202  transcription antitermination protein NusG  50 
 
 		 176 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1526  transcription antitermination protein NusG  49.42 
 
 		 176 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  48 
 
 		 175 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1249  transcription antitermination protein NusG  46.78 
 
 		 175 aa  171  5e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1210  transcription antitermination protein NusG  46.78 
 
 		 175 aa  171  5e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1894  NusG antitermination factor  47.73 
 
 		 177 aa  170  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0214948  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3473  transcription antitermination protein NusG  49.42 
 
 		 176 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.106397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0973  transcription antitermination protein NusG  48.84 
 
 		 176 aa  168  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00943054 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1942  transcription antitermination protein NusG  46.2 
 
 		 175 aa  169  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.321032  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3997  transcription termination/antitermination factor NusG  46.02 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.183871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4478  NusG antitermination factor  46.02 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4366  NusG antitermination factor  46.02 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1818  transcription antitermination protein NusG  48.84 
 
 		 176 aa  168  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  47.43 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1319  transcription antitermination protein NusG  48.26 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.20753  normal  0.259679 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  48.3 
 
 		 175 aa  166  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1417  transcription antitermination protein NusG  48.26 
 
 		 176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.311768 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1824  transcription antitermination protein NusG  48.82 
 
 		 174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446524  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  45.88 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  44.77 
 
 		 175 aa  164  5e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2700  transcription antitermination protein NusG  46.51 
 
 		 176 aa  164  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  43.1 
 
 		 175 aa  164  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3845  NusG antitermination factor  46.29 
 
 		 177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  44.19 
 
 		 176 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  44.71 
 
 		 175 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  45.2 
 
 		 181 aa  161  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1807  transcription antitermination protein nusG  42.77 
 
 		 177 aa  161  6e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.379623  normal  0.264433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  44.89 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  44.89 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  44.89 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  44.89 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  44.89 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  44.89 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  44.89 
 
 		 185 aa  160  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0754  transcription antitermination protein NusG  47.13 
 
 		 177 aa  159  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0919  transcription antitermination protein nusG  46.86 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542135  hitchhiker  0.00000170909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0835  transcription antitermination protein nusG  44 
 
 		 176 aa  159  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000261776  normal  0.0934709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  43.68 
 
 		 174 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  44.32 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  44.32 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1321  transcription antitermination protein NusG  44.83 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.885271 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3863  NusG antitermination factor  44.77 
 
 		 176 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0971314 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  44.32 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  44.32 
 
 		 185 aa  159  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1342  NusG antitermination factor  44.19 
 
 		 176 aa  158  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.204626  normal  0.0694294 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  44.32 
 
 		 185 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  44.32 
 
 		 185 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  44.32 
 
 		 185 aa  158  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  44.32 
 
 		 185 aa  158  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0921  NusG antitermination factor  44.12 
 
 		 175 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3340  NusG antitermination factor  44.12 
 
 		 175 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014891 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  43.43 
 
 		 243 aa  158  4e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  41.34 
 
 		 178 aa  157  5e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3645  NusG antitermination factor  43.6 
 
 		 198 aa  157  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0446  transcription antitermination protein nusG  43.68 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.144554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2181  NusG antitermination factor  47.09 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  43.68 
 
 		 177 aa  157  9e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  43.68 
 
 		 177 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1025  transcription antitermination protein NusG  41.95 
 
 		 176 aa  156  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3339  transcription antitermination protein NusG  43.26 
 
 		 193 aa  156  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0583  NusG antitermination factor  43.6 
 
 		 203 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  43.68 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3194  transcription antitermination protein NusG  43.26 
 
 		 193 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178337  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1444  NusG antitermination factor  44.25 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4447  transcription antitermination protein nusG  43.6 
 
 		 199 aa  155  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0158403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  40.11 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  43.75 
 
 		 185 aa  155  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3872  NusG antitermination factor  44.51 
 
 		 188 aa  154  5.0000000000000005e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  40.34 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0505  NusG antitermination factor  43.6 
 
 		 194 aa  154  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  45.71 
 
 		 199 aa  154  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0485  NusG antitermination factor  44.19 
 
 		 177 aa  154  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00514524  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0314  transcription termination/antitermination factor NusG  44.19 
 
 		 177 aa  154  9e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.655686  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0041  NusG antitermination factor  42.05 
 
 		 190 aa  153  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000273158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5091  transcription antitermination protein NusG  43.43 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000183077  normal  0.524031 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3597  NusG antitermination factor  42.44 
 
 		 202 aa  153  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.259347  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  41.95 
 
 		 180 aa  153  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0668  NusG antitermination factor  41.62 
 
 		 175 aa  153  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.652128  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3350  transcription antitermination protein NusG  42.86 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.309973  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4536  transcription antitermination protein nusG  43.6 
 
 		 197 aa  153  1e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.151972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2336  NusG antitermination factor  44.19 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.045954  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0348  NusG antitermination factor  41.62 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.789152  normal  0.714428 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1704  transcription antitermination protein nusG  41.62 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.999252  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3456  transcription antitermination protein NusG  43.35 
 
 		 192 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.147926  normal  0.436073 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0037  NusG antitermination factor  42.29 
 
 		 190 aa  152  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000759472  hitchhiker  0.0000000000226007 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0334  NusG antitermination factor  41.62 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0344546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2547  NusG antitermination factor  41.62 
 
 		 178 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>