More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1375 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_1375  NusG antitermination factor  100 
 
 		 176 aa  353  5.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000078055  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1930  NusG antitermination factor  44.25 
 
 		 175 aa  161  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000062864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0210  NusG antitermination factor  46.82 
 
 		 178 aa  160  8.000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000666853  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0180  transcription antitermination protein nusG  46.51 
 
 		 174 aa  158  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000727534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2725  NusG antitermination factor  45.98 
 
 		 181 aa  157  7e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0672465  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2347  NusG antitermination factor  43.02 
 
 		 203 aa  157  7e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00861255  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2473  transcription antitermination protein nusG  44.19 
 
 		 175 aa  154  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147395  decreased coverage  0.00105272 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0202  NusG antitermination factor  46.47 
 
 		 175 aa  149  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000100106  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0885  transcription antitermination protein nusG  45.66 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0219053  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_866  transcription antiterminator  45.09 
 
 		 177 aa  148  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00385803  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0994  transcription antitermination protein NusG  45.66 
 
 		 177 aa  147  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000169889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0405  NusG antitermination factor  43.6 
 
 		 175 aa  147  5e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000272103  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01040  NusG antitermination factor  45.35 
 
 		 176 aa  145  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.9624500000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1103  NusG antitermination factor  43.18 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00324857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0854  transcription antitermination protein NusG  44.71 
 
 		 174 aa  144  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000907525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0307  NusG antitermination factor  43.6 
 
 		 172 aa  144  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000155754  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0273  NusG antitermination factor  45.35 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000233733  hitchhiker  0.00819689 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2719  transcription antitermination protein nusG  44.19 
 
 		 177 aa  142  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00403072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1544  NusG antitermination factor  41.28 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.52343  normal  0.525349 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1477  NusG antitermination factor  40.59 
 
 		 187 aa  141  4e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0560518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3325  NusG antitermination factor  40 
 
 		 194 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0701558  normal  0.115804 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0559  transcription antitermination protein  41.04 
 
 		 182 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00288108  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0573  transcription antitermination protein  41.04 
 
 		 182 aa  138  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08690  transcription antitermination protein nusG  43.1 
 
 		 178 aa  139  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000619667  hitchhiker  0.000000019364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4321  NusG antitermination factor  39.41 
 
 		 194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0895327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0121  NusG antitermination factor  40.72 
 
 		 188 aa  138  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.978934  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0093  transcription antitermination protein NusG  41.24 
 
 		 177 aa  137  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09670  transcription antitermination protein nusG  41.38 
 
 		 178 aa  137  8.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00365981  hitchhiker  0.0000231337 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1824  NusG antitermination factor  41.18 
 
 		 201 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2130  NusG antitermination factor  43.02 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0645684  normal  0.768925 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0177  transcription termination/antitermination factor NusG  40.46 
 
 		 182 aa  135  3.0000000000000003e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0856403  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0643  NusG antitermination factor  43.16 
 
 		 190 aa  135  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.313093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0237  NusG antitermination factor  41.3 
 
 		 192 aa  134  7.000000000000001e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.45612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2991  transcription antitermination protein nusG  37.79 
 
 		 184 aa  133  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0268  transcription antitermination protein nusG  40.44 
 
 		 192 aa  134  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000582831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2687  NusG antitermination factor  42.46 
 
 		 185 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4020  NusG antitermination factor  42.2 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.579663  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0444  NusG antitermination factor  36 
 
 		 183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4681  transcription antitermination protein nusG  40.46 
 
 		 199 aa  131  5e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000131174  hitchhiker  0.00867825 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1175  NusG antitermination factor  41.01 
 
 		 181 aa  131  5e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000364949  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1181  NusG antitermination factor  42.46 
 
 		 185 aa  131  6e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00327311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0697  NusG antitermination factor  38.95 
 
 		 176 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804947  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2226  NusG antitermination factor  39.2 
 
 		 179 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0470266 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0386  NusG antitermination factor  37.85 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1532  NusG antitermination factor  42.94 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000537782  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1587  transcription antitermination protein nusG  38.07 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1450  NusG antitermination factor  36.57 
 
 		 184 aa  129  3e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2276  NusG antitermination factor  38.07 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2364  NusG antitermination factor  38.07 
 
 		 179 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0318836  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1056  NusG antitermination factor  40.7 
 
 		 175 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.654649  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2077  NusG antitermination factor  36.63 
 
 		 179 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0689  transcription termination/antitermination factor NusG  37.93 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.8031099999999993e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2659  transcription antitermination protein NusG  39.11 
 
 		 250 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.208003  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1512  NusG antitermination factor  41.38 
 
 		 181 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000324122  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2727  transcription antitermination protein NusG  38.15 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000231541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2413  transcription antitermination protein NusG  38.15 
 
 		 173 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000134964  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1013  NusG antitermination factor  37.16 
 
 		 306 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5109  NusG antitermination factor  36.96 
 
 		 280 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.210055  normal  0.503084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0568  transcription antitermination protein nusG  40.23 
 
 		 277 aa  125  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3736  transcription antitermination protein NusG  37.57 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.192921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3890  transcription antitermination protein NusG  37.57 
 
 		 181 aa  125  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0134744  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6062  NusG antitermination factor  40.23 
 
 		 273 aa  124  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.275139  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03858  transcription antitermination protein NusG  36.78 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000783565  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4013  NusG antitermination factor  36.78 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5447  transcription antitermination protein NusG  36.78 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000061444  hitchhiker  0.00794731 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4521  transcription antitermination protein NusG  36.78 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000238759  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4430  transcription antitermination protein NusG  36.78 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852563  hitchhiker  0.00000586315 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4043  transcription antitermination protein NusG  36.78 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000183625  hitchhiker  0.00769513 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4215  transcription antitermination protein NusG  36.78 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3776099999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03811  hypothetical protein  36.78 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000794784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0097  transcription antitermination protein NusG  41.14 
 
 		 177 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000931665  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2853  transcription antitermination protein NusG  38.73 
 
 		 185 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0969707  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4470  transcription antitermination protein NusG  36.78 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000671893  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2646  transcription antitermination protein NusG  38.73 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1909  transcription antitermination protein NusG  38.73 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000000000847824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3791  transcription antitermination protein NusG  38.73 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000837051  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3821  transcription antitermination protein NusG  38.73 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3081  transcription antitermination protein NusG  38.73 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0106863  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3759  transcription antitermination protein NusG  38.73 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000163041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3464  transcription antitermination protein NusG  38.73 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00605291  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3183  transcription antitermination protein NusG  38.73 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000738018  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2868  transcription antitermination protein NusG  38.95 
 
 		 175 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.157482  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3657  transcription antitermination protein NusG  38.15 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000000822613 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1631  NusG antitermination factor  36.99 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1334  NusG antitermination factor  38.15 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0792615  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2786  NusG antitermination factor  36.36 
 
 		 180 aa  123  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000144907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0614  transcription antitermination protein nusG  38.37 
 
 		 175 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0301  transcription antitermination protein NusG  38.15 
 
 		 185 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00942193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3938  transcription termination/antitermination factor NusG  38.76 
 
 		 242 aa  123  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0263  transcription antitermination protein NusG  38.15 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00191516  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0236  transcription antitermination protein NusG  38.15 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.176958  normal  0.0127315 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3434  transcription antitermination protein NusG  38.15 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00962421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4330  NusG antitermination factor  38.76 
 
 		 242 aa  123  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2772  transcription antitermination protein NusG  38.15 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.268118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0254  transcription antitermination protein NusG  38.15 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0335  transcription antitermination protein NusG  38.15 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00697763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0314  transcription antitermination protein NusG  38.15 
 
 		 185 aa  123  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00007649  normal  0.212857 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0314  NusG antitermination factor  37.85 
 
 		 193 aa  122  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000044126  decreased coverage  0.000127563 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4442  transcription antitermination protein NusG  37.21 
 
 		 185 aa  122  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4480  transcription antitermination protein NusG  36.21 
 
 		 181 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0050057  decreased coverage  0.0000000000000047886 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>